Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1234567 151 - 200 av 1205
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 151.
    Borén, Therese
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kvinnors och barns hälsa.
    Study of proteins related to the thyroid in the endometrium of women with unexplained infertilityTherese Borén2014Självständigt arbete på grundnivå (högskoleexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    Infertility is a global health issue that can have many causes. It is, however, not always known why some couples cannot conceive even though there are no apparent reason in either the man or the woman. The woman can have normal menstrual cycles and the man can have normal semen.The purpose of this study was to investigate the presence and distribution of thyroid related proteins in endometrial biopsies. Eight biopsies was taken from women with unexplained infertility and 35 biopsies from healthy fertile woman. These were divided into smaller groups based on menstrual cycle day and analysed with immunohistochemistry for the detection of the thyroid related proteins MCT8 and DIO2.There were no significant differences between the groups and therefore are more studies required in the subject to be able to find factors that may help solving some cases of unexplainedinfertility.

  • 152. Bose, Indranil
    et al.
    Ohlander, Anna
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Kutter, Christoph
    Russom, Aman
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi.
    DNA Analysis on integrated all foil based microdevicesManuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
  • 153.
    Boström, Markus
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    Utvärdering av 16S rRNA PCR vid mikrobiologisk diagnostik av misstänkt ortopedisk implantat infektioner2016Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 154.
    Braian, Clara
    et al.
    Linköpings universitet, Institutionen för klinisk och experimentell medicin, Avdelningen för mikrobiologi och molekylär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten.
    Svensson, Mattias
    Karolinska Institute, Sweden.
    Brighenti, Susanna
    Karolinska Institute, Sweden.
    Lerm, Maria
    Linköpings universitet, Institutionen för klinisk och experimentell medicin, Avdelningen för mikrobiologi och molekylär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten.
    Parasa, Venkata R.
    Linköpings universitet, Institutionen för klinisk och experimentell medicin, Avdelningen för mikrobiologi och molekylär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Karolinska Institute, Sweden.
    A 3D Human Lung Tissue Model for Functional Studies on Mycobacterium tuberculosis Infection2015Ingår i: Journal of Visualized Experiments, ISSN 1940-087X, E-ISSN 1940-087X, nr 104, s. 1-9, artikel-id e53084Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Tuberculosis (TB) still holds a major threat to the health of people worldwide, and there is a need for cost-efficient but reliable models to help us understand the disease mechanisms and advance the discoveries of new treatment options. In vitro cell cultures of monolayers or co-cultures lack the three-dimensional (3D) environment and tissue responses. Herein, we describe an innovative in vitro model of a human lung tissue, which holds promise to be an effective tool for studying the complex events that occur during infection with Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis). The 3D tissue model consists of tissue-specific epithelial cells and fibroblasts, which are cultured in a matrix of collagen on top of a porous membrane. Upon air exposure, the epithelial cells stratify and secrete mucus at the apical side. By introducing human primary macrophages infected with M. tuberculosis to the tissue model, we have shown that immune cells migrate into the infected-tissue and form early stages of TB granuloma. These structures recapitulate the distinct feature of human TB, the granuloma, which is fundamentally different or not commonly observed in widely used experimental animal models. This organotypic culture method enables the 3D visualization and robust quantitative analysis that provides pivotal information on spatial and temporal features of host cell-pathogen interactions. Taken together, the lung tissue model provides a physiologically relevant tissue micro-environment for studies on TB. Thus, the lung tissue model has potential implications for both basic mechanistic and applied studies. Importantly, the model allows addition or manipulation of individual cell types, which thereby widens its use for modelling a variety of infectious diseases that affect the lungs.

  • 155.
    Brattsand, Göran
    et al.
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biovetenskap, Klinisk kemi.
    Nordin, Gunnar
    Isaksson, Anders
    Bjellerup, Per
    Stridsberg, Mats
    Hård, Lena
    Ankarberg-Lindgren, Carina
    Becker, Charlotte
    Gustafsson, Sven
    Larsson, Kerstin
    Equalis/SFKK rekommenderar harmonisering av enheter vid hormonbestämningar för säkrare vård2012Ingår i: Läkartidningen, ISSN 0023-7205, E-ISSN 1652-7518, Vol. 109, nr 39-40, s. 1773-1773Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
  • 156.
    Bravo, Mayra
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    Genetisk kartläggning av mygg: Artbestämning av mygg genom barcoding2011Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 157. Breimer, Lars H
    et al.
    Eriksson, Clas-Göran
    Nilsson, Torbjörn K
    Klinisk kemi, Laboratoriemedicinska länskliniken, Örebros universitetssjukhus, och Hälsoakademin, Örebro universitet, Örebro, Sverige.
    [Tomorrow's laboratory - already yesterday]2012Ingår i: Läkartidningen, ISSN 0023-7205, E-ISSN 1652-7518, Vol. 109, nr 37, s. 1624-1624Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 158.
    Breimer, Lars H.
    et al.
    Fac Med & Hlth, Dept Lab Med, Örebro University Hospital, Örebro, Sweden.
    Nilsson, Torbjorn K.
    Dept Med Biosci, Clin Chem, Umeå Univ, Umeå, Sweden.
    Is Ferrotoxicity a New Great Public Health Challenge?2015Ingår i: Clinical Chemistry, ISSN 0009-9147, E-ISSN 1530-8561, Vol. 61, nr 4, s. 667-668Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 159.
    Breimer, Lars H.
    et al.
    Departments of Laboratory Medicine, Örebro University Hospital, Örebro, Sweden.
    Nilsson, Torbjörn K.
    Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskap och medicin. Department of Clinical Medicine, Biomedicine, Örebro University, Örebro, Sweden; Departments of Laboratory Medicine, Örebro University Hospital, Örebro, Sweden.
    Has folate a role in the developing nervous system after birth and not just during embryogenesis and gestation?2012Ingår i: Scandinavian Journal of Clinical and Laboratory Investigation, ISSN 0036-5513, E-ISSN 1502-7686, Vol. 72, nr 3, s. 185-191Artikel, forskningsöversikt (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    It is now 30 years since the first publications stating that supplementation with folate could prevent neural tube defects appeared and 20 years since the definitive data, including prevention of other birth defects. Since then epidemiological studies and animal experiments have identified folate as a molecule at the crossroads of neural development. Fortification of food has greatly reduced the incidence of spina bifida. Much interest has focussed on long-term sequelae in children born to mothers severely deprived of folate (and other nutrients) such as during the Dutch Hunger Winter of 1944 and in poor parts of the world. In addition, deficiency in folate and B12 are increasingly discussed as a possible contributing factor in dementia and congenital orofacial and heart malformations. The year 2011 saw the publication of a study that implicated low folate intake in poorer school performance of adolescents as judged by school marks. This has enormous social implications but needs confirmation from other settings. This review assesses the current state of evidence and sets the data in context of whether folate has a role in the development and plasticity of the nervous system even after birth, with particular emphasis on childhood and adolescence.

  • 160. Breimer, Lars H
    et al.
    Nilsson, Torbjörn K
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biovetenskap, Klinisk kemi.
    Is ferrotoxicity a new great public health challenge?2015Ingår i: Clinical Chemistry, ISSN 0009-9147, E-ISSN 1530-8561, Vol. 61, nr 4, s. 667-668Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
  • 161.
    Brevestedt, Emelie
    Linnéuniversitetet, Fakulteten för Hälso- och livsvetenskap (FHL), Institutionen för kemi och biomedicin (KOB).
    Hur exponeras barn för ftalater i sin inomhusmiljö på förskolan?2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Ftalater är ett ämne som har till syfte att verka mjukgörande i plast. Ftalater finns i flera material och produkter i vår omgivning t ex i leksaker, elektronik, textilier och i inredningsmaterial. De problem som uppkommer i samband med användandet av ftalater i produkter är att ftalaterna inte är kovalent bundna till sitt material och därmed kan dessa frigöras ut i luft och damm. Flera ftalater är klassade som hormonstörande ämnen och kan påverka flera viktiga funktioner i kroppen. Barn är en extra känslig grupp då flera av deras organ ännu inte är färdigutvecklade och är beroende av ett fungerande endokrint system.

     

    Barn spenderar en stor del av sin vardag på förskolan och det ställer krav på deras inomhusmiljö. Studier visar på att koncentrationerna av ftalater är 2-4 gånger så hög i förskolans inomhusmiljö som i hemmiljön. Med tanke på att barn har flera organsystem under utveckling är det viktigt att fasa ut onödiga källor för exponering av ftalater.

     

    Arbetets syfte är att kartlägga ftalater i inomhusmiljön på förskolor i Växjö kommun och att undersöka pedagogers medvetenhet kring ämnet. Arbetet utgår från tidigare vetenskapliga artiklar och en enkätundersökning som personal på 46 förskolor i Växjö kommun har besvarat.

     

    Studier som undersökt inomhusmiljöer visar på att det förekommer höga koncentrationer av ftalater som är begränsade enligt REACH-förordningen. Då ftalater finns i flera produkter blir det många olika exponeringskällor och det gör det viktigt att fasa ut onödiga källor för att minska koncentrationen av ftalater i luft och damm. De mest intressanta resultat som kommit fram via enkätundersökningen är att det förekommer plastgolv i de flesta lokaler, elektronik finns i de rum där barnen spenderar mest tid och att barn använder “vuxna leksaker” såsom äldre elektronik, väskor och skor. Ett resultat som visar att barn lever i en allt mer vuxen miljö med produkter som är avsedda för vuxna. Sådana produkter täcks inte in av de begränsningar som REACH-förordningen skapat och täcks inte heller av de nya leksaksdirektiven.  

    Förskolepedagogerna uppger sig vara medvetna om ämnet ftalater men ändå visar undersökningen att det finns en rad olika brister i kunskap. Det är därför viktigt att öka kunskapen och medvetenheten kring ämnet för att på så sätt fasa ut onödiga källor för exponering av ftalater. 

  • 162.
    Brinck, Kajsa
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    Ultraljuds effekt på bakterier: Studie av ultraljuds effekt på bakterier vid olika temperaturer och frekvenser av ultraljud.2011Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 163.
    Broberg, Annette
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap. Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biovetenskap, Klinisk kemi.
    Betydelse av provtagningsrör för faktorer i fibrinolysen2014Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 164.
    Broddesson, Sandra
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kvinnors och barns hälsa.
    Evaluation of an automated multiplex real-time RT-PCR assay for rapid detection of Influenza A and B viruses2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    Influenza is a viral infection that affects global health and economy with its endemic and sometimes pandemic spread. Rapid detection of Influenza viruses enables antiviral use and can bring financial savings. It is also essential for the global surveillance of prevalent Influenza strains. RT-PCR is considered the most specific and sensitive method for detection of Influenza, but Influenza mutates at a high rate and it is therefore crucial that RT-PCR methods are updated regularly.

    In 2014, Cepheid released their Xpert Flu/RSV XC assay, which can detect Influenza A and B and RSV by multiplex RT-PCR in approximately one hour. The aim of this study was to evaluate this assay at Laboratoriemedicin Västernorrland by using the laboratory’s previous PCR assay for detection of Influenza viruses as reference method.

    Real-time RT-PCR was used to compare Xpert Flu/RSV XC to the reference method. A dilution series was performed to estimate the methods’ PCR efficiencies and precision was calculated from quadruplicates of a positive control sample. Clinical specimens (n=42) were used to evaluate the diagnostic sensitivity and specificity of Xpert Flu/RSV XC. Objective statistical analysis of PCR data was performed and discussed.

    The Xpert Flu/RSV XC was equivalent to the reference method and demonstrated high diagnostic sensitivity and specificity. Estimated PCR efficiencies were however low.

    With the introduction of Xpert Flu/RSV XC to the laboratory follows many potential benefits, primarily in form of a simplified pre analytical procedure and a shortened analysis time. The Xpert Flu/RSV XC assay enables fast diagnosis of Influenza infection.

  • 165.
    Brodin, Henrik
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Medicinsk informatik. Linköpings universitet, Tekniska högskolan.
    CCASENSE: Canonical Correlation Analysis for Estimation of Sensitivity Maps for Fast MRI2006Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats
    Abstract [en]

    Magnetic Resonance Imaging is an established technology for both imaging and functional studies in clinical and research environments. The field is still very research intense. Two major research areas are acquisition time and signal quality. The last decade has provided tools for more efficient possibilities of trading these factors against each other through parallel imaging. In this thesis one parallel imaging method, Sensitivity Encoding for fast MRI (SENSE) is examined. An alternative solution CCASENSE is developed. CCASENSE reduces the acquisition time by estimating the sensitivity maps required for SENSE to work instead of running a reference scan. The estimation process is done by Blind Source Separation through Canonical Correlation Analysis. It is shown that CCASENSE appears to estimate the sensitivity maps better than ICASENSE which is a similar algorithm.

  • 166.
    Brokvist, Helena
    Linnéuniversitetet, Fakultetsnämnden för naturvetenskap och teknik, Institutionen för naturvetenskap, NV.
    Autolyserade pneumokocker kan modulera cytokinsvaret hos humana monocyter2011Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 15 poäng / 22,5 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 167.
    Brolin, Malin
    Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskaper.
    Detektion av antikroppar mot Francisella tularensis i serum med chemiluminescence och immunokromatografiskt snabbtest2017Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 168.
    Broman, Mikael
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk cellbiologi.
    Frenckner, Bjorn
    Bjallmark, Anna
    Broome, Michael
    Recirculation during veno-venous extra-corporeal membrane oxygenation - a simulation study2015Ingår i: International Journal of Artificial Organs, ISSN 0391-3988, E-ISSN 1724-6040, Vol. 38, nr 1, s. 23-30Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Purpose: Veno-venous ECMO is indicated in reversible life-threatening respiratory failure without life-threatening circulatory failure. Recirculation of oxygenated blood in the ECMO circuit decreases efficiency of patient oxygen delivery but is difficult to measure. We seek to identify and quantify some of the factors responsible for recirculation in a simulation model and compare with clinical data. Methods: A closed-loop real-time simulation model of the cardiovascular system has been developed. ECMO is simulated with a fixed flow pump 0 to 5 l/min with various cannulation sites -1) right atrium to inferior vena cava, 2) inferior vena cava to right atrium, and 3) superior+ inferior vena cava to right atrium. Simulations are compared to data from a retrospective cohort of 11 consecutive adult veno-venous ECMO patients in our department. Results: Recirculation increases with increasing ECMO-flow, decreases with increasing cardiac output, and is highly dependent on choice of cannulation sites. A more peripheral drainage site decreases recirculation substantially. Conclusions: Simulations suggest that recirculation is a significant clinical problem in veno-venous ECMO in agreement with clinical data. Due to the difficulties in measuring recirculation and interpretation of the venous oxygen saturation in the ECMO drainage blood, flow settings and cannula positioning should rather be optimized with help of arterial oxygenation parameters. Simulation may be useful in quantification and understanding of recirculation in VV-ECMO.

  • 169.
    Brun, Anders
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Medicinsk informatiK. Linköpings universitet, Tekniska högskolan.
    Manifold learning and representations for image analysis and visualization2006Licentiatavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    We present a novel method for manifold learning, i.e. identification of the low-dimensional manifold-like structure present in a set of data points in a possibly high-dimensional space. The main idea is derived from the concept of Riemannian normal coordinates. This coordinate system is in a way a generalization of Cartesian coordinates in Euclidean space. We translate this idea to a cloud of data points in order to perform dimension reduction. Our implementation currently uses Dijkstra's algorithm for shortest paths in graphs and some basic concepts from differential geometry. We expect this approach to open up new possibilities for analysis of e.g. shape in medical imaging and signal processing of manifold-valued signals, where the coordinate system is “learned” from experimental high-dimensional data rather than defined analytically using e.g. models based on Lie-groups.

    We propose a novel post processing method for visualization of fiber traces from DT-MRI data. Using a recently proposed non-linear dimensionality reduction technique, Laplacian eigenmaps (Belkin and Niyogi, 2002), we create a mapping from a set of fiber traces to a low dimensional Euclidean space. Laplacian eigenmaps constructs this mapping so that similar traces are mapped to similar points, given a custom made pairwise similarity measure for fiber traces. We demonstrate that when the low-dimensional space is the RGB color space, this can be used to visualize fiber traces in a way which enhances the perception of fiber bundles and connectivity in the human brain.

  • 170.
    Brun, Anders
    et al.
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Medicinsk informatik. Linköpings universitet, Tekniska högskolan. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Knutsson, Hans
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Medicinsk informatik. Linköpings universitet, Tekniska högskolan. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Tensor Glyph Warping - Visualizing Metric Tensor Fields using Riemannian Exponential Maps2009Ingår i: Visualization and Processing of Tensor Fields: Advances and Perspectives / [ed] Laidlaw, David H.; Weickert, Joachim, Springer Berlin/Heidelberg, 2009, s. 139-160Kapitel i bok, del av antologi (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The Riemannian exponential map, and its inverse the Riemannian logarithm map, can be used to visualize metric tensor fields. In this chapter we first derive the well-known metric sphere glyph from the geodesic equations, where the tensor field to be visualized is regarded as the metric of a manifold. These glyphs capture the appearance of the tensors relative to the coordinate system of the human observer. We then introduce two new concepts for metric tensor field visualization: geodesic spheres and geodesically warped glyphs. These additions make it possible not only to visualize tensor anisotropy, but also the curvature and change in tensorshape in a local neighborhood. The framework is based on the exp maps, which can be computed by solving a second order Ordinary Differential Equation (ODE) or by manipulating the geodesic distance function. The latter can be found by solving the eikonal equation, a non-linear Partial Differential Equation (PDE), or it can be derived analytically for some manifolds. To avoid heavy calculations, we also include first and second order Taylor approximations to exp and log. In our experiments, these are shown to be sufficiently accurate to produce glyphs that visually characterize anisotropy, curvature and shape-derivatives in smooth tensor fields. 

  • 171.
    Brus, Annelie
    Karlstads universitet, Fakulteten för hälsa, natur- och teknikvetenskap (from 2013), Institutionen för hälsovetenskaper.
    Är det någon skillnad mellan odlingsplattorna för MRSA, ESBL och VRE?: Från två olika tillverkare av kromogena odlingsplattor för MRSA, ESBL och VRE.2016Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 172.
    Budnjo, Almir
    Högskolan i Skövde, Institutionen för biovetenskap.
    Gene expression of MAP2K1 and Cyclin D1 in BDII rat model of Endometrial cancer2016Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    Endometrial adenocarcinoma (EAC) is the most frequently diagnosed gynecological cancer of the female genital tract in the Western world. Research studies in EC is difficult to conduct on human tumor samples due to the complex nature of tumor arousal and genetic heterogeneousness in the human population. Therefore, inbred animal models can be promising tools to use in EC research due to similar histopathology and pathogenesis as humans. Studies performed on MAP2K1 and CCND1 has shown that their altered expression play a crucial role in carcinogenesis. CCND1 has been demonstrated to have oncogenic properties when overexpressed in human neoplasias.

    The aim of this study is to investigate gene expression levels of MAP2K1 and CCND1 in BDII rat model of endometrial adenocarcinoma cells. Quantitative real-time PCR was used to analyze expression levels of MAP2K1 and CCND1 genes in BDII/Han rat model of endometrial cancer cells using TaqMan approach. The differences in gene expression levels of MAP2K1 and CCND1 between pathologically EAC malignant and nonmalignant cells showed an upregulation of MAP2K1 and CCND1 in EAC malignant cells. The analyzed data presented observable mean differences between MAP2K1 and CCND1 in several endometrial cell lines that were examined.

    Although no statistical significance was reached, an alteration in gene expression levels in malignant and nonmalignant endometrial cells could be observed. Furthermore, this present study shows observable upregulation of MAP2K1 and CCND1 in endometrial carcinoma cells vs. nonmalignant endometrium cells and encourages further investigation of the role of CCND1 and MAP2K genes in endometrial carcinogenesis.

  • 173.
    Buendia, Ruben
    et al.
    Högskolan i Borås, Institutionen Ingenjörshögskolan.
    Gil-Pita, Roberto
    Seoane, Fernando
    Högskolan i Borås, Institutionen Ingenjörshögskolan.
    Cole Parameter Estimation from the Modulus of the Electrical Bioimpeadance for Assessment of Body Composition. A Full Spectroscopy Approach2011Ingår i: Journal of Electrical Bioimpedance, ISSN 1891-5469, E-ISSN 1891-5469, Vol. 2, s. 72-78Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Activities around applications of Electrical Bioimpedance Spectroscopy (EBIS) have proliferated in the past decade significantly. Most of these activities have been focused in the analysis of the EBIS measurements, which eventually might enable novel applications. In Body Composition Assessment (BCA), the most common analysis approach currently used in EBIS is based on the Cole function, which most often requires curve fitting. One of the most implemented approaches for obtaining the Cole parameters is performed in the impedance plane through the geometrical properties that the Cole function exhibit in such domain as depressed semi-circle. To fit the measured impedance data to a semi-circle in the impedance plane, obtaining the Cole parameters in an indirect and sequential manner has several drawbacks. Applying a Non-Linear Least Square (NLLS) iterative fitting on the spectroscopy measurement, obtains the Cole parameters considering the frequency information contained in the measurement. In this work, from experimental total right side EBIS measurements, the BCA parameters have been obtained to assess the amount and distribution of whole body fluids. The values for the BCA parameters have been obtained using values for the Cole parameters estimated with both approaches: circular fitting on the impedance plane and NLLS impedance-only fitting. The comparison of the values obtained for the BCA parameters with both methods confirms that the NLLS impedance-only is an effective alternative as Cole parameter estimation method in BCA from EBIS measurements. Using the modulus of the Cole function as the model for the fitting would eliminate the need for performing phase detection in the acquisition process, simplifying the hardware specifications of the measurement instrumentation when implementing a bioimpedance spectrometer.

  • 174. Buendia, Ruben
    et al.
    Seoane, Fernando
    Högskolan i Borås, Institutionen Ingenjörshögskolan.
    Gil-Pita, Roberto
    A Novel Approach for Removing the Hook Effect Artefact from Electrical Bioimpedance Spectroscopy Measurements2009Ingår i: Journal of Physics: Conference Series, Institute of Physics Publishing Ltd. , 2009Konferensbidrag (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Very often in Electrical Bioimpedance (EBI) spectroscopy measurements the presence of stray capacitances creates a measurement artefact commonly known as Hook Effect. Such an artefact creates a hook-alike deviation of the EBI data noticeable when representing the measurement on the impedance plane. Such Hook Effect is noticeable at high frequencies but it also causes a data deviation at lower measurement frequencies. In order to perform any accurate analysis of the EBI spectroscopy data, the influence of the Hook Effect must be removed. An established method to compensate the hook effect is the well known Td compensation, which consist on multiplying the obtained spectrum, Zmeas() by a complex exponential in the form of exp[jTd]. Such a method cannot correct entirely the Hook Effect since the hook-alike deviation occurs a broad frequency range in both magnitude and phase of the measured impedance, and by using a real value for Td. First, a real value only modifies the phase of the measured impedance and second, it can only correct the Hook Effect at a single frequency. In addition, the process to select a value for Td by an iterative process with the aim to obtain the best Cole fitting lacks solid scientific grounds. In this work the Td compensation method is revisited and a modified approach for correcting the Hook Effect that includes a novel method for selecting the correcting values is proposed. The initial validation results confirm that the proposed method entirely corrects the Hook Effect at all frequencies.

  • 175.
    Buendia, Ruben
    et al.
    Högskolan i Borås, Institutionen Ingenjörshögskolan.
    Seoane Martinéz, Fernando
    Högskolan i Borås, Institutionen Ingenjörshögskolan.
    Harris, M.
    Caffarel, J.
    Gil, R.
    Hook Effect Correction & Resistance-based Cole Fitting Prior Cole Model-based Analysis: Experimental Validation2010Konferensbidrag (Refereegranskat)
  • 176.
    Bunlang, Sawai
    Karlstads universitet, Fakulteten för hälsa, natur- och teknikvetenskap (from 2013), Institutionen för hälsovetenskaper.
    Effekt av ftalaterna DiNP och MiNP på morfologi och celltillväxt i SH-SY5Y humana neuroblastom celler2016Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 177.
    Burla, Bo
    et al.
    Singapore Lipidomics Incubator (SLING), Life Sciences Institute, National University of Singapore, Singapore.
    Arita, Makoto
    Laboratory for Metabolomics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan; Cellular and Molecular Epigenetics Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, Yokohama, Japan; Division of Physiological Chemistry and Metabolism, Keio University Faculty of Pharmacy, Tokyo, Japan.
    Arita, Masanori
    National Institute of Genetics, Shizuoka, Japan and RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Yokohama, Japan.
    Bendt, Anne K.
    Singapore Lipidomics Incubator (SLING), Life Sciences Institute, National University of Singapore, Singapore.
    Cazenave-Gassiot, Amaury
    Department of Biochemistry, YLL School of Medicine, National University of Singapore, Singapore.
    Dennis, Edward A.
    Departments of Pharmacology and Chemistry and Biochemistry, School of Medicine, University of California at San Diego, La Jolla, CA, USA.
    Ekroos, Kim
    Lipidomics Consulting Ltd., Esbo, Finland.
    Han, Xianlin
    Barshop Institute for Longevity and Aging Studies and Department of Medicine-Diabetes, University of Texas Health Science Center at San Antonio, San Antonio, TX, USA.
    Ikeda, Kazutaka
    Laboratory for Metabolomics, RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan; Cellular and Molecular Epigenetics Laboratory, Graduate School of Medical Life Science, Yokohama City University, Yokohama, Japan.
    Liebisch, Gerhard
    Institute of Clinical Chemistry and Laboratory Medicine, University of Regensburg, Regensburg, Germany.
    Lin, Michelle K.
    Department of Biochemistry, YLL School of Medicine, National University of Singapore, Singapore.
    Loh, Tze Ping
    Department of Laboratory Medicine, National University Hospital, Singapore.
    Meikle, Peter J.
    Baker Heart and Diabetes Institute, Melbourne, Victoria, Australia.
    Orešič, Matej
    Örebro universitet, Institutionen för medicinska vetenskaper. Turku Centre for Biotechnology, University of Turku, Turku, Finland; Åbo Akademi University, Turku, Finland.
    Quehenberger, Oswald
    Departments of Pharmacology and Medicine, School of Medicine, University of California at San Diego, La Jolla, CA, USA.
    Shevchenko, Andrej
    Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany.
    Torta, Federico
    Department of Biochemistry, YLL School of Medicine, National University of Singapore, Singapore.
    Wakelam, Michael J. O.
    Babraham Institute, Cambridge, United Kingdom.
    Wheelock, Craig E.
    Division of Physiological Chemistry 2, Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institute, Stockholm, Sweden.
    Wenk, Markus R.
    Singapore Lipidomics Incubator (SLING), Life Sciences Institute, National University of Singapore, Singapore; Department of Biochemistry, YLL School of Medicine, National University of Singapore, Singapore.
    MS-based lipidomics of human blood plasma: a community-initiated position paper to develop accepted guidelines2018Ingår i: Journal of Lipid Research, ISSN 0022-2275, E-ISSN 1539-7262, Vol. 59, nr 10, s. 2001-2017Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Human blood is a self-regenerating lipid-rich biological fluid that is routinely collected in hospital settings. The inventory of lipid molecules found in blood plasma (plasma lipidome) offers insights into individual metabolism and physiology in health and disease. Disturbances in the plasma lipidome also occur in conditions that are not directly linked to lipid metabolism; therefore, plasma lipidomics based on MS is an emerging tool in an array of clinical diagnostics and disease management. However, challenges exist in the translation of such lipidomic data to clinical applications. These relate to the reproducibility, accuracy, and precision of lipid quantitation, study design, sample handling, and data sharing. This position paper emerged from a workshop that initiated a community-led process to elaborate and define a set of generally accepted guidelines for quantitative MS-based lipidomics of blood plasma or serum, with harmonization of data acquired on different instrumentation platforms across independent laboratories as an ultimate goal. We hope that other fields may benefit from and follow such a precedent.

  • 178.
    Burén, Victoria
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    Riskbedömning gällande humant papilloma virus (HPV) kontamination: Undersökning av den analysprocess från provtagning, cytologisk utstryk på glas till amplifiering av DNA som bidrar till diagnos av cervixcancer2014Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 179.
    Byhlén, Liselott
    Linnéuniversitetet, Fakulteten för Hälso- och livsvetenskap (FHL), Institutionen för kemi och biomedicin (KOB).
    Enterobacteriaceae och amoxicillin-klavulansyra: Effekt av bestämt förhållande respektive bestämd koncentration av klavulansyra på MIC-värden och zon/MIC-korrelation2013Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Förekomsten av bakterier med olika typer av resistensmekanismer ökar globalt. De varianter som på engelska benämns ”Extended spectrum β-lactamases” (ESBL) är en heterogen grupp β- laktamaser som genom hydrolys inaktiverar β-laktamantibiotika och därigenom ger resistens mot bland annat β -laktamantibiotika som penicilliner och cefalosporiner. Resistensbestämning på kliniska laboratorier utförs huvudsakligen med lappdiffusion eller Minimum Inhibiting Concentration (MIC)-bestämning med gradienttester. Infektioner orsakade av ESBL-producerande organismer kan behandlas med β-laktamantibiotika kombinerat med en β-laktamasinhibitor. I Europa rekommenderas resistensbestämning med bestämd koncentration β-laktamasinhibitor, men produkter på marknaden saknas.

    Syftet med projektet var att utvärdera olika typer av gradienttester med amoxicillin- klavulansyra från två leverantörer (Etest och MIC Test Strip, MTS) och undersöka hur klavulansyra påverkar resistensbestämningen, samt att se hur resultat från lappdiffusion korrelerar med resultat från ovan nämnda tester.

    Lappdiffusion och MIC- bestämning med gradienttester med antingen bestämt förhållande av amoxicillin-klavulansyra (2:1) (Etest och MTS) eller bestämd koncentration klavulansyra (2mg/L) (MTS) utfördes med Escherichia coli (både med ESBL-positiva och ESBL-negativa stammar) samt med Proteus mirabilis. ESBL-detektion med cefpodoxim och cefpodoxim-klavulansyra utfördes parallellt.

    För P. mirabilis korrelerade lappdiffusionsresultat mycket bra med resultat från samtliga gradienttester. För E. coli korrelerade lappdiffusionsresultat mycket bra med MIC-värden vid användning av Etest 2:1 medan MTS 2:1 gav högre MIC-värden än referensdistributionen och resulterade i sämre korrelation. MIC-bestämning med MTS 2 mg/L resulterade i högre MIC-värden.

    Den nuvarande zonbrytpunkten behöver justeras för att korrelera med tolkningen från amoxicillin-klavulansyra med bestämd koncentration av klavulansyra 2 mg/L, framförallt för ESBL- producerande E. coli.

  • 180.
    Bylund, Olof
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    Lokal validering av GLI 2012: En retrospektiv studie om referensvärden för spirometri vid klinisk fysiologi i Umeå2016Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 181.
    Bzdula, Jessica
    Linköpings universitet, Hälsouniversitetet.
    Den preanalytiska fasen – Hur viktigt är det att blanda serumrören?2014Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Bakgrund: Cirka 2/3 av alla preanalytiska fel uppkommer i den preanalytiska fasen, där blandning av provrör direkt efter provtagningen är en av faktorerna. Studiens syfte var att jämföra analysresultaten för glukos, laktatdehydrogenas samt kalium i serum från blandade rör med oblandade rör. Studiens syfte var även att undersöka hållbarheten på dessa tre analyter i rumstemperatur (25 °C) under sju dagar.

    Metod: 100 blandade och 100 oblandade serumrör med gel, från 100 patienter, analyserades på Architect ci2800. Analysresultaten jämfördes statistiskt med parat t-test. Alla serumrör förvarades i rumstemperatur under sju dagar och de tre analyterna analyserades dagligen. Analysresultaten jämfördes statistiskt med ANOVA.

    Resultat: Studien visade ingen statistiskt signifikant skillnad (p > 0,05) för glukos samt kalium mellan de oblandade och blandade rören. Laktatdehydrogenas uppvisar en statistiskt signifikant skillnad (p < 0,05) mellan de oblandade och blandade rören. Skillnaderna i hållbarheten mellan dag 1, dag 2 och dag 7 för glukos, laktatdehydrogenas och kalium visade sig vara statistiskt signifikanta (p < 0,05).

    Slutsats: Studien indikerar att det inte är nödvändigt att blanda serumrören direkt efter provtagningen men det är viktigt att blanda andra typer av rör, exempelvis citratrör, därför är det bra att skapa sig en rutin då man blandar alla rör. Glukos är den mest stabila analyten i rumstemperatur i sju dagar medan kalium är den minst stabila.

  • 182.
    Bäcklund, Madeleine
    Örebro universitet, Hälsoakademin.
    Molekylärgenetisk typning av Propionibacterium acnes isolerade från prostata, perineum och panna hos patienter med prostatacancer2011Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 183.
    Bäcklund, Tomas
    et al.
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för strålningsvetenskaper.
    Frankel, Jennifer
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för strålningsvetenskaper, Radiofysik.
    Israelsson, Hanna
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för farmakologi och klinisk neurovetenskap, Klinisk neurovetenskap. Vrinnevi Hospital, Norrköping, Sweden.
    Malm, Jan
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för farmakologi och klinisk neurovetenskap, Klinisk neurovetenskap.
    Sundström, Nina
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för strålningsvetenskaper.
    Trunk sway in idiopathic normal pressure hydrocephalus: quantitative assessment in clinical practice2017Ingår i: Gait & Posture, ISSN 0966-6362, E-ISSN 1879-2219, s. 62-70, artikel-id 54Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background: In diagnosis and treatment of patients with idiopathic normal pressure hydrocephalus (iNPH), there is need for clinically applicable, quantitative assessment of balance and gait. Using a body worn gyroscopic system, the aim of this study was to assess postural stability of iNPH patients in standing, walking and during sensory deprivation before and after cerebrospinal fluid (CSF) drainage and surgery. A comparison was performed between healthy elderly (HE) and patients with various types of hydrocephalus (ventriculomegaly (VM)).

    Methods: Trunk sway was measured in 31 iNPH patients, 22 VM patients and 58 HE. Measurements were performed at baseline in all subjects, after CSF drainage in both patient groups and after shunt surgery in the iNPH group.

    Results: Preoperatively, the iNPH patients had significantly higher trunk sway compared to HE, specifically for the standing tasks (p < 0.001). Compared to VM, iNPH patients had significantly lower sway velocity during gait in three of four cases on firm support (p < 0.05). Sway velocity improved after CSF drainage and in forward-backward direction after surgery (p < 0.01). Compared to HE both patient groups demonstrated less reliance on visual input to maintain stable posture.

    Conclusions: INPH patients had reduced postural stability compared to HE, particularly during standing, and for differentiation between iNPH and VM patients sway velocity during gait is a promising parameter. A reversible reduction of visual incorporation during standing was also seen. Thus, the gyroscopic system quantitatively assessed postural deficits in iNPH, making it a potentially useful tool for aiding in future diagnoses, choices of treatment and clinical follow-up. 

  • 184.
    Bäckryd, Emmanuel
    et al.
    Linköping University, Linköping, Sweden.
    Lind, Anne-Li
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper.
    Thulin, Måns
    Uppsala universitet, Humanistisk-samhällsvetenskapliga vetenskapsområdet, Samhällsvetenskapliga fakulteten, Statistiska institutionen.
    Larsson, Anders
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper.
    Gerdle, Björn
    Linköping University, Linköping, Sweden.
    Gordh, Torsten
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kirurgiska vetenskaper.
    High Levels of Cerebrospinal Fluid Chemokines Point to the Presence of Neuroinflammation in Peripheral Neuropathic Pain: A Cross-Sectional Study of Two Cohorts of Patients Compared to Healthy ControlsManuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Animal models suggest that chemokines are important mediators in the pathophysiology of neuropathic pain. Indeed, these substances have been called “gliotransmitters”, a term that illustrates the close interplay between glial cells and neurons in the context of neuroinflammation and pain. However, evidence in humans is scarce. The aim of the study was to determine a comprehensive cerebrospinal fluid (CSF) inflammatory profile for neuropathic pain patients. Our hypothesis was that we would thereby find indications of a postulated on-going process of central neuroinflammation.  

    CSF samples were collected from two cohorts of patients with neuropathic pain (n=11 and n=16, respectively) and healthy controls (n=11). The samples were analyzed with a multiplex proximity extension assay in which 92 inflammation-related proteins were measured simultaneously (Proseek® Multiplex Inflammation I, Olink Bioscience, Uppsala, Sweden). Univariate testing with control of false discovery rate, as well as orthogonal partial least squares – discriminant analysis, were used for statistical analyses.

    CSF levels of chemokines CXCL6, CXCL10, CCL8, CCL11, CCL23, as well as protein LAPTGF-beta-1, were significantly higher in both neuropathic pain cohorts compared to healthy controls, pointing to neuroinflammation in patients. These 6 proteins were also major results in a recent similar study in fibromyalgia patients. The findings need to be confirmed in larger cohorts, and the question of causality remains to be settled. Since it has been suggested that prevalent co-morbidities to chronic pain (e.g., depression, anxiety, poor sleep, and tiredness) also are associated with inflammation, it will be important to determine whether inflammation is a common mediator.

  • 185.
    Bäckström, Annie
    Linnéuniversitetet, Fakulteten för Hälso- och livsvetenskap (FHL), Institutionen för kemi och biomedicin (KOB).
    Jämförelse mellan två nedkylningsmetoder av helblodsenheter för vidare framställning av trombocytkoncentrat avsedda för transfusion2018Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Trombocytopeni behandlas primärt med trombocyttransfusion. Trombocytkoncentraten kan erhållas genom poolning av lättcellskikt framställda ur helblodsenheter från flera blodgivare. Helblodsenheterna kyls vanligen ner på en CompoCool®-platta för att snabbt komma ner till rumstemperatur och kan då prepareras redan efter 2 h. Detta brukar vara logistiskt fördelaktigt och gynnar erytrocyterna som framställs ur samma helblodsenheter. Det går även att låta helblodsenheterna kylas ner i rumstemperatur vilket å andra sidan sägs ge ett högre trombocytutbyte då studier visat att trombocyter är känsliga för kyla. Syftet med examensarbetet var att framställa och jämföra kvaliteten på trombocytkoncentrat där helblodsenheten hade kylts ner på CompoCool®-platta respektive kylts ner i rumstemperatur. Hypotesen var att trombocytutbytet skulle bli högre vid nedkylning av helblodsenheten i rumstemperatur än vid nedkylning på CompoCool®-platta. Framställningen av trombocytkoncentraten gjordes genom poolning av 5 st lättcellskikt och en påse trombocytsuspensionsmedium efterföljt av centrifugering och separation i en automatisk blodkomponents separator. Kvalitén utvärderades med avseende på trombocytkoncentration, leukocytkoncentration, swirling samt bakterieodling. Samtliga resultat för kvalitetskontrollerna låg inom de rekommenderade gränsvärdena. Det beräknade t-testet för trombocytkoncentrationen var högre än det kritiska t-värdet vilket innebar att det var en signifikant skillnad mellan de olika nedkylningsmetoderna. Genom användning av de erhållna resultaten kunde hypotesen bekräftas och slutsatsen dras att trombocytutbytet är signifikant högre då helblodsenheten kyls ner i rumstemperatur jämfört med CompoCool®-platta. 

  • 186.
    Bäckström, Michelle
    Umeå universitet, Medicinska fakulteten, Institutionen för klinisk mikrobiologi, Biomedicinsk laboratorievetenskap.
    IgE-förekomst i lymfoida och endokrina organ: jämförelse mellan NOD-och B6-möss2013Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 187.
    Börjesson, Emma
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten.
    Analys av 25-hydroxyvitamin D i primärvården2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 180 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Bakgrund: Intresset för vitamin D har ökat de senare åren. Det beror dels på att det finns många eventuella positiva effekter av vitamin D och dels på att många individer har brist på vitamin D. Nutidens människa spenderar mycket tid inomhus vilket leder till lägre nivåer av vitamin D. Personer som har utvandrat från ett soligt klimat till nordiskt klimat får ofta brist på grund av en mer pigmenterad hud som behöver större mängd UVB för att få en adekvat syntes av vitamin D.

    Syfte: Syftet med den här studien är att jämföra och utvärdera hur lika det patientnära instrumentet mini VIDAS mäter 25(OH)D total mot befintlig metod cobas e 602. Diskussion om analysen 25(OH)D total har en plats i primärvården ingår även i studien.

    Metod: Jämförelsen baserades på 39 st prover. Proven analyserades på cobas e 602 och mini VIDAS. Ett precisionsförsök gjordes. Externkontroller från DEQAS inkluderades även i studien. Resultaten har presenterats genom enkel linjär regressionsanalys, medelvärde, SD och CV.

    Resultat: Jämförelsen mellan cobas e 602 och mini VIDAS gav en förklaringsgrad på 81,43 %. mini VIDAS var närmst externkontrollernas målvärden.

    Slutsats: Det går inte att dra självklara slutsatser ifall mini VIDAS uppfyller kraven att införas i primärvården. Förklaringsgraden som är på 81,43 % bör vara minst 95 %. Däremot överensstämmer mini VIDAS med externkontrollerna bättre än cobas e 602. Det finns faktorer som tyder på att analysen 25(OH)D har en plats i primärvården med avseende på efterfrågan, användningsområde och antal individer med brist. Instrumentet är dessutom användarvänligt för ett primärvårdslaboratorium.

  • 188.
    Bülow, Katrin
    Örebro universitet, Institutionen för hälsovetenskap och medicin.
    Jämförelse av selektivitet för Clostridium difficile mellan två olika odlingsmedier2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 189.
    Caesar, Jenny
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Medicinsk informatik. Linköpings universitet, Tekniska högskolan.
    Segmentation of the Brain from MR Images2005Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats
    Abstract [en]

    KTH, Division of Neuronic Engineering, have a finite element model of the head. However, this model does not contain detailed modeling of the brain. This thesis project consists of finding a method to extract brain tissues from T1-weighted MR images of the head. The method should be automatic to be suitable for patient individual modeling.

    A summary of the most common segmentation methods is presented and one of the methods is implemented. The implemented method is based on the assumption that the probability density function (pdf) of an MR image can be described by parametric models. The intensity distribution of each tissue class is modeled as a Gaussian distribution. Thus, the total pdf is a sum of Gaussians. However, the voxel values are also influenced by intensity inhomogeneities, which affect the pdf. The implemented method is based on the expectation-maximization algorithm and it corrects for intensity inhomogeneities. The result from the algorithm is a classification of the voxels. The brain is extracted from the classified voxels using morphological operations.

  • 190.
    Cakici, Baki
    et al.
    KTH, Skolan för informations- och kommunikationsteknik (ICT), Kommunikation: Infrastruktur och tjänster, Programvaru- och datorsystem, SCS.
    Hebing, Kenneth
    Swedish Institute for Infectious Control (SMI), Solna, Sweden.
    Grünewald, Maria
    Swedish Institute for Infectious Control (SMI), Solna, Sweden.
    Saretok, Paul
    Swedish Institute for Infectious Control (SMI), Solna, Sweden.
    Hulth, Anette
    Swedish Institute for Infectious Control (SMI), Solna, Sweden.
    CASE: a framework for computer supported outbreak detection2010Ingår i: BMC Medical Informatics and Decision Making, ISSN 1472-6947, E-ISSN 1472-6947, Vol. 10, s. 14-Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background: In computer supported outbreak detection, a statistical method is applied to a collection of cases to detect any excess cases for a particular disease. Whether a detected aberration is a true outbreak is decided by a human expert. We present a technical framework designed and implemented at the Swedish Institute for Infectious Disease Control for computer supported outbreak detection, where a database of case reports for a large number of infectious diseases can be processed using one or more statistical methods selected by the user. Results: Based on case information, such as diagnosis and date, different statistical algorithms for detecting outbreaks can be applied, both on the disease level and the subtype level. The parameter settings for the algorithms can be configured independently for different diagnoses using the provided graphical interface. Input generators and output parsers are also provided for all supported algorithms. If an outbreak signal is detected, an email notification is sent to the persons listed as receivers for that particular disease. Conclusions: The framework is available as open source software, licensed under GNU General Public License Version 3. By making the code open source, we wish to encourage others to contribute to the future development of computer supported outbreak detection systems, and in particular to the development of the CASE framework.

  • 191.
    Camacho, Emely
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi.
    Optimization of Lentivirus Production for Cancer Therapy2011Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    Vectors based on lentivirus backbones have revolutionized our ability to transfer genesinto many cell types. Lentiviral vectors integrate into the chromatin of target cells and do not transfer any viral genes causing vector replication. Both of these features arecommonly used in gene therapy and have been used clinically in individuals sufferingfrom cancer, infections and genetic diseases. It has been discovered that T-cells can be genetically modified to be used as effective weapons against cancer: therefore virus mustbe produced to deliver the gene of interest into the T-cells. In this project, lentiviralvectors have been produced to transfer the gene coding for a chimeric antigen receptor(CAR) which is directed to CD19 on B-cells. The vectors will, hence, be used to generateCD19 retargeted T-cells in purpose to kill CD19 cells such as B-cell lymphoma andleukemia. We have evaluated two production protocols to determine a feasible method toculture these vectors. We have also stimulate T-cells with two different antibodies (anti-CD3 and anti-CD28) and transduced T-cells. Our results demonstrate that theconcentration of virus was higher after prolonged incubation in 4˚C, which can not beexplained. The stimulation demonstrated that bound anti-CD3 was the best stimulator,and moreover the FACS-analysis showed that addition of anti-CD28 gave a highertransduction level. In conclusion, the viral vectors may be kept in 4˚C for two days beforeconcentrating the virus, and bound anti-CD3 is a better choice than soluble anti-CD3 forstimulation of T-cells.

  • 192.
    Campillay, Amaya
    Karlstads universitet.
    Laktatdehydrogenas som ny point-of-care test för nyfödda barn: En precisionsanalys2013Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 193.
    Cao, Minlu
    Karlstads universitet, Fakulteten för hälsa, natur- och teknikvetenskap (from 2013), Institutionen för hälsovetenskaper.
    Role of PPAR-γ in Human Neuroblastoma (SH-SY5Y) Cell Differentiation: Effects on cell number and gene expression2014Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 194.
    Carlie, Katarina
    Linnéuniversitetet, Fakulteten för Hälso- och livsvetenskap (FHL), Institutionen för kemi och biomedicin (KOB).
    Spädbarns tarmflora & probiotikas effekt vid kolik: Kan skillnader i spädbarns tarmflora förklara kolik och är probiotika en effektiv behandling vid kolik?2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Ett av fem spädbarn drabbas av kolik under första tre levnadsmånaderna. I övrigt friska spädbarn skriker, gråter och är otröstbara minst tre timmar i sträck per dag mer än tre dagar i veckan. Trots att kolik är ett vanligt förekommande problem för både spädbarn och föräldrar finns det idag ingen effektiv behandling. Etiologin är oklar men rökning och mental ohälsa hos modern prepartum, födoämnesallergi och ett outvecklat magtarmsystem hos spädbarnet tros vara några bidragande faktorer. Denna litteraturstudie granskar åtta artiklar för att dels undersöka skillnaderna i tarmfloran mellan spädbarn med och utan kolik, om skillnaderna kan förklara kolik samt probiotikas effekt vid kolik. Granskade studier visar att förekomsten av Proteobacteria, koliforma bakterier och Escherichia coli är högre hos spädbarn med kolik. Till skillnad från spädbarn utan kolik uppvisar kolikbarn en mindre bakteriell mångfald, mindre kolonisation av Bacteroidetes och de gynnsamma bakteriesläkterna Lactobacillus och Bifidobacterium. Hos ammade kolikbarn som behandlades med den probiotiska bakteriestammen Lactobacillus reuteri DSM 17938 erhölls i två av tre studier  god effekt av probiotika utan några biverkningar där gråttiden reducerats till mer än hälften. Resultatet varierar geografiskt och evidensen kring probiotikas effekt hos flaskmatade spädbarn med kolik är fortfarande bristfällig. Det är oklart om en förändrad tarmflora kan orsaka kolik eller är ett resultat av koliken då tarmfloran är mycket komplex och fler studier inom området behövs.

  • 195.
    Carls, Stefan
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för kvinnors och barns hälsa.
    Optimization of pyrosequencing method for copy number analysis of CYP2D62017Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [en]

    CYP2D6, a member of the cytochrome P450 enzyme system, has a central role in drug metabolism, it metabolizes 25 % of clinically used drugs. The gene that codes for the enzyme displays a high degree of polymorphism, which effects enzyme functions to various degrees. Aside from smaller mutations like SNPs, alleles may also feature duplications or deletion of the whole gene. Due to the clinical relevance of these mutations, a simple and precise method for genotyping is needed. In this study, a method based on pyrosequencing for copy number analysis was evaluated, wherein the copy number was determined by relative quantification to a reference gene CYP2D8P. During evaluation of the method, several adjustments were tried for optimization, including adjustments of annealing temperature and primer concentration. The results showed a difficulty in distinguishing between copy numbers using the method, as well as a high coefficient of variation. Therefore, further optimization is required before the method could be implemented into clinical practice.

  • 196.
    Carlsson, Lars
    Örebro universitet, Institutionen för klinisk medicin.
    Impedanskardiografi med Physio flow kontra ”Fick´s direkt” för beräkning av hjärtminutvolym på elitskidåkare under stakning.2007Självständigt arbete på grundnivå (yrkesexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
    Abstract [sv]

    Trots tidigare oenighet bland forskare är den allmänna uppfattningen idag att det är hjärtminutvolymen (HMV) som är den enskilt största begränsande faktorn för maximalt syreupptag under arbete. Fortfarande råder dock osäkerhet bland arbetsfysiologer huruvida slagvolymen (SV) planar ut, minskar eller stiger vid maximalt arbete. En av de största utmaningarna inom arbetsfysiologin är utvecklandet av en tillförlitlig, billig och enkel non-invasiv utrustning i syfte att kunna mäta dessa parametrar. Detta har lett fram till metoden impedanskardiografi som baseras på motståndet av elektriska signaler som skickas genom thorax. Tidigare studier har visat på hög validitet mellan den impedanskardiografiska utrustningen Physio flowTM och den invasiva metoden ”Fick´s direkt” i vila och under cykelarbete på otränade. I detta arbete har ett första försök på elitskidåkare (n = 6) gjorts i syfte att jämföra metoderna under stakning, dessutom jämfördes resultaten av slagvolymen från impedansutrustningen mellan submaximalt och maximalt arbete. Resultatet visade att inte heller denna studie med säkerhet kunde skilja metoderna åt, vare sig under submaximalt arbete (p = 0,43) eller vid maximalt arbete (p = 0,17). Det ska dock poängteras att Fick´s beräkningsmetod modifierats i syfte att undvika katetrar genom hjärtat under maximal stakning, vilket kan ha påverkat resultatet. En intressant observation gällande SV gjordes mellan submaximal och maximal stakning. Här noterades en ökning från 150,1 till 175,5 ml (p = 0,01) vilket motsäger Åstrands klassiska ”platåteori” från 1964.

  • 197.
    Carlsson, Paula
    Karlstads universitet, Fakulteten för hälsa, natur- och teknikvetenskap (from 2013), Institutionen för hälsovetenskaper.
    Påverkan på tillväxt och apoptos hos KCL22 i närvaro av Imatinib och Montelukast, separat samt kombinerat2015Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
  • 198.
    Casas Garcia, Belén
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten.
    Towards Personalized Models of the Cardiovascular System Using 4D Flow MRI2018Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Current diagnostic tools for assessing cardiovascular disease mostly focus on measuring a given biomarker at a specific spatial location where an abnormality is suspected. However, as a result of the dynamic and complex nature of the cardiovascular system, the analysis of isolated biomarkers is generally not sufficient to characterize the pathological mechanisms behind a disease. Model-based approaches that integrate the mechanisms through which different components interact, and present possibilities for system-level analyses, give us a better picture of a patient’s overall health status.

    One of the main goals of cardiovascular modelling is the development of personalized models based on clinical measurements. Recent years have seen remarkable advances in medical imaging and the use of personalized models is slowly becoming a reality. Modern imaging techniques can provide an unprecedented amount of anatomical and functional information about the heart and vessels. In this context, three-dimensional, three-directional, cine phase-contrast (PC) magnetic resonance imaging (MRI), commonly referred to as 4D Flow MRI, arises as a powerful tool for creating personalized models. 4D Flow MRI enables the measurement of time-resolved velocity information with volumetric coverage. Besides providing a rich dataset within a single acquisition, the technique permits retrospective analysis of the data at any location within the acquired volume.

    This thesis focuses on improving subject-specific assessment of cardiovascular function through model-based analysis of 4D Flow MRI data. By using computational models, we aimed to provide mechanistic explanations of the underlying physiological processes, derive novel or improved hemodynamic markers, and estimate quantities that typically require invasive measurements. Paper I presents an evaluation of current markers of stenosis severity using advanced models to simulate flow through a stenosis. Paper II presents a framework to personalize a reduced-order, mechanistic model of the cardiovascular system using exclusively non-invasive measurements, including 4D Flow MRI data. The modelling approach can unravel a number of clinically relevant parameters from the input data, including those representing the contraction and relaxation patterns of the left ventricle, and provide estimations of the pressure-volume loop. In Paper III, this framework is applied to study cardiovascular function at rest and during stress conditions, and the capability of the model to infer load-independent measures of heart function based on the imaging data is demonstrated. Paper IV focuses on evaluating the reliability of the model parameters as a step towards translation of the model to the clinic.

  • 199.
    Casas Garcia, Belén
    et al.
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Lantz, Jonas
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Viola, Frederica
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten.
    Cedersund, Gunnar
    Linköpings universitet, Institutionen för medicinsk teknik, Avdelningen för medicinsk teknik. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten.
    Bolger, Ann F.
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Region Östergötland, Hjärt- och Medicincentrum, Fysiologiska kliniken US. University of Calif San Francisco, CA USA.
    Carlhäll, Carljohan
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Region Östergötland, Hjärt- och Medicincentrum, Fysiologiska kliniken US. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Karlsson, Matts
    Linköpings universitet, Institutionen för ekonomisk och industriell utveckling, Mekanisk värmeteori och strömningslära. Linköpings universitet, Tekniska fakulteten. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Ebbers, Tino
    Linköpings universitet, Institutionen för medicin och hälsa, Avdelningen för kardiovaskulär medicin. Linköpings universitet, Medicinska fakulteten. Region Östergötland, Hjärt- och Medicincentrum, Fysiologiska kliniken US. Linköpings universitet, Centrum för medicinsk bildvetenskap och visualisering, CMIV.
    Bridging the gap between measurements and modelling: a cardiovascular functional avatar2017Ingår i: Scientific Reports, ISSN 2045-2322, E-ISSN 2045-2322, Vol. 7, artikel-id 6214Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Lumped parameter models of the cardiovascular system have the potential to assist researchers and clinicians to better understand cardiovascular function. The value of such models increases when they are subject specific. However, most approaches to personalize lumped parameter models have thus far required invasive measurements or fall short of being subject specific due to a lack of the necessary clinical data. Here, we propose an approach to personalize parameters in a model of the heart and the systemic circulation using exclusively non-invasive measurements. The personalized model is created using flow data from four-dimensional magnetic resonance imaging and cuff pressure measurements in the brachial artery. We term this personalized model the cardiovascular avatar. In our proof-of-concept study, we evaluated the capability of the avatar to reproduce pressures and flows in a group of eight healthy subjects. Both quantitatively and qualitatively, the model-based results agreed well with the pressure and flow measurements obtained in vivo for each subject. This non-invasive and personalized approach can synthesize medical data into clinically relevant indicators of cardiovascular function, and estimate hemodynamic variables that cannot be assessed directly from clinical measurements.

  • 200.
    Cedergren, Linda
    Uppsala universitet, Medicinska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi.
    Expression of recombinant protein including an His-tag to facilitate purification for diagnosis of CCHF and Lassa Viruses2006Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats
    Abstract [en]

    Abstract

    Crimean-Congo Hemorrhagic Fever virus (CCHF) and Lassa virus are giving sources illness to humans. In addition to zoonotic transmission, CCHF and Lassa virus can spread from person to person. After a short incubation period, CCHF and Lassa virus infections are characterized by a sudden onset of high fever, chills, headache and cough just like flu. Even some people are vomiting and have diarrhoea. After a few days of illness hemorrhagic manifestations occur. Treatment options for CCHF and Lassa viruses are limited, and there is no vaccine available for use in humans. The purpose of the present study was to produce recombinant nucleocapsid protein of Lassavirus and CCHF virus including an aminoterminal His-tag by a Semliki Forest Virus Replicon (pSFV 4.2). The recombinant proteins are planned to be used in future development of diagnostic methods.

1234567 151 - 200 av 1205
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf