Endre søk
Begrens søket
1 - 8 of 8
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Treff pr side
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
  • Standard (Relevans)
  • Forfatter A-Ø
  • Forfatter Ø-A
  • Tittel A-Ø
  • Tittel Ø-A
  • Type publikasjon A-Ø
  • Type publikasjon Ø-A
  • Eldste først
  • Nyeste først
  • Skapad (Eldste først)
  • Skapad (Nyeste først)
  • Senast uppdaterad (Eldste først)
  • Senast uppdaterad (Nyeste først)
Merk
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1.
    Anlind, Nils
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Eriksson, Alexandra
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Gromova, Arina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Hong, Marcus
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Ljungström, Sara
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Markstedt, Olof
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Marknadsanalys av proteinstandarder för kvantitativ masspektrometri2015Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 poäng / 15 hpOppgave
    Abstract [sv]

    QPrEST är en ny intern standard för absolut kvantifiering av proteiner utvecklat av företaget Atlas Antibodies AB. I en marknad där det redan finns etablerade standarder kan det vara svårt att konkurrera ut de nuvarande produkterna. Därför har denna rapport gjorts vilken består av en marknadsanalys av nuvarande standarder, statistisk undersökning av publicerade artiklar inom absolut kvantitativ proteomik samt en global kundundersökning med 35 svarande. Resultaten har legat till grund för förbättringsförslag till Atlas Antibodies AB för bättre marknadsföring och lansering av sin nya produkt, QPrEST. Slutsatsen från denna rapport är att Atlas Antibodies AB måste nischa in sin produkt till kvantifiering av ett målprotein då det är där standarden presterar bäst.

  • 2.
    Bagge, Joakim
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Hedman, Erik
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Smedsrud, Sabina
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Svärdström, Cornelia
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Söderberg, Elisabeth
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Valdez, Fernando
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Utveckling av metodik för påvisning och typning av Listeria i livsmedelskedjan2017Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 poäng / 15 hpOppgave
  • 3.
    Ladhani, Laila
    et al.
    KTH, Skolan för elektro- och systemteknik (EES), Mikro- och nanosystemteknik.
    Pardon, Gaspard
    KTH, Skolan för elektro- och systemteknik (EES), Mikro- och nanosystemteknik.
    Meeuws, Hanne
    Janssen Diagnostics.
    van Wesenbeeck, Liesbeth
    Janssen Diagnostics.
    Schmidt, Kristiane
    Janssen Diagnostics.
    Stuyver, Lieven
    Janssen Diagnostics .
    van der Wijngaart, Wouter
    KTH, Skolan för elektro- och systemteknik (EES), Mikro- och nanosystemteknik.
    Sampling and detection of airborne influenza virus towards point-of-care applications2017Inngår i: PLoS ONE, ISSN 1932-6203, E-ISSN 1932-6203, PlosONEArtikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    Airborne transmission of the influenza virus contributes significantly to the spread of this infectious pathogen, particularly over large distances when carried by aerosol droplets with long survival times. Efficient sampling of virus-loaded aerosol in combination with a low limit of detection of the collected virus could enable rapid and early detection of airborne influenza virus at the point-of-care setting. Here, we demonstrate a successful sampling and detection of airborne influenza virus using a system specifically developed for such applications. Our system consists of a custom-made electrostatic precipitation (ESP)-based bioaerosol sampler that is coupled with downstream quantitative polymerase chain reaction (qPCR) analysis. Aerosolized viruses are sampled directly into a miniaturized collector with liquid volume of 150 μL, which constitutes a simple and direct interface with subsequent biological assays. This approach reduces sample dilution by at least one order of magnitude when compared to other liquid-based aerosol bio-samplers. Performance of our ESP-based sampler was evaluated using influenza virus-loaded sub-micron aerosols generated from both cultured and clinical samples. Despite the miniaturized collection volume, we demonstrate a collection efficiency of at least 10% and sensitive detection of a minimum of 3721 RNA copies. Furthermore, we show that an improved extraction protocol can allow viral recovery of down to 303 RNA copies and a maximum sampler collection efficiency of 47%. A device with such a performance would reduce sampling times dramatically, from a few hours with current sampling methods down to a couple of minutes with our ESP-based bioaerosol sampler.

  • 4.
    Lundstedt, Erik Torbjörn
    et al.
    AcureOmics AB.
    Trygg, Johan
    Umeå universitet, Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten, Kemiska institutionen.
    Gabrielsson, Jon Robert
    AcureOmics AB.
    Ekström, Gunilla
    Anamar AB.
    METABOLIC PROFILES2012Patent (Annet (populærvitenskap, debatt, mm))
    Abstract [en]

    Abstract: The invention relates to the use of endogenous metabolites to produce a metabolic profile of a disorder or disease in a subject, e.g. an autoimmune disease, in particular rheumatoid arthritis, and the analysis of such metabolic profiles in order to find disturbances in such profiles in a subject which are caused by or correlated with the said diseases or disorders. Such disturbances can be normalised by treatment of the subject with specified compounds, particularly N-(2-chloro-3,4-dimethoxybenzylideneamino)guanidine or an aminoguanidine.

  • 5.
    Nordesjö, Olle
    et al.
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Pontén, Victor
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Herman, Stephanie
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Ås, Joel
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Jamal, Sabri
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Nyberg, Alona
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för biologisk grundutbildning.
    Ett sannolikhetsbaserat kvalitetsmått förbättrar klassificeringen av oförväntade sekvenser i in situ sekvensering2014Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 poäng / 15 hpOppgave
    Abstract [sv]

    In situ sekvensering är en metod som kan användas för att lokalisera differentiellt uttryck av mRNA direkt i vävnadssnitt, vilket kan ge viktiga ledtrådar om många sjukdomstillstånd. Idag förloras många av sekvenserna från in situ sekvensering på grund av det kvalitetsmått man använder för att säkerställa att sekvenser är korrekta. Det finns troligtvis möjlighet att förbättra prestandan av den nuvarande base calling-metoden eftersom att metoden är i ett tidigt utvecklingsskede. Vi har genomfört explorativ dataanalys för att undersöka förekomst av systematiska fel och korrigerat för dessa med hjälp av statistiska metoder. Vi har framförallt undersökt tre metoder för att korrigera för systematiska fel:

    I) Korrektion av överblödning som sker på grund avöverlappande emissionsspektra mellan fluorescenta prober.

    II) En sannolikhetsbaserad tolkningav intensitetsdata som resulterar i ett nytt kvalitetsmått och en alternativ klassificerare baseradpå övervakad inlärning.

    III) En utredning om förekomst av cykelberoende effekter, exempelvisofullständig dehybridisering av fluorescenta prober.

    Vi föreslår att man gör följande saker:

    • Implementerar och utvärderar det sannolikhetsbaserade kvalitetsmåttet
    • Utvecklar och implementerar den föreslagna klassificeraren
    • Genomför ytterligare experiment för att påvisa eller bestrida förekomst av ofullständigdehybridisering
  • 6.
    Periyannan Rajeswari, Prem Kumar
    et al.
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi.
    Soderberg, Lovisa M
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi.
    Andersson Svahn, Helene
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi.
    Jönsson, Håkan
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi.
    Color-coded bead based readout from droplet PCR for the detection of pathogen biomarkersManuskript (preprint) (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    We present a workflow using fluorescent color-coded Luminex beads to detect the

    outcome of droplet PCR assay. The assay was performed to detect three important

    poultry pathogens: avian influenza, infectious laryngotracheitis virus and

    campylobacter. Droplet-based TaqMan PCR has been commonly used for detection

    of rare and significant biomarkers in clinical samples. However, the spectral overlap

    of fluorescent TaqMan probes limits the detection to 5 different targets in a single

    assay. The color codes of the Luminex detection beads allowed accurate classification

    of the different bead sets used in this assay concurrently. The target-specific capture

    probes coupled to distinct bead sets enabled capture and detection of target DNA in

    the droplet. The capture assay detected target DNA of all three poultry pathogens with

    high specificity, from samples with average target concentration of 1 template per

    droplet. This workflow demonstrates that the detection panel of droplet PCR assay

    can be increased to potentially detect multiple targets in a sample by utilizing the

    scalability offered by the color-coded detection beads.

  • 7.
    Söderberg, Lovisa
    et al.
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Fonseca, Pedro
    Karolinska Intitutet, Department of Oncology and Pathology.
    Panaretakis, Theocharis
    Karolinska Intitutet, Department of Oncology and Pathology.
    Jönsson, Håkan
    KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Detection of single exosomes in microfluidic droplets by RT-PCR amplification of 18S RNA contentManuskript (preprint) (Annet vitenskapelig)
    Abstract [en]

    We present a workflow for reverse transcription-PCR (RT-PCR) in microfluidic droplets to identify exosomes based on their RNA content. Available techniques for exosome detection have been limited to size or surface markers which limit their diagnostic capabilities. Exosome detection based on RNA content could be developed to be used as a diagnostic, prognostic or predictive tool for cancer based on specific RNA biomarkers in liquid biopsies. In this manuscript we demonstrate a high throughput method for the amplification of exosome derived 18S RNA in microfluidic droplets. Automated image analysis using open source software was applied to distinguish and count PCR-positive droplets with fluorescent intensity over a set threshold. We benchmark our workflow against picoliter scale RT-PCR on serially diluted exosome samples and demonstrate the ability of the droplet based workflow to correctly rank exosome samples based on exosome concentration.  This represents a key step towards a quantitative analysis of exosomal RNA content and the sorting of single exosomes by their RNA content.

  • 8. Zambrano, Jesús
    et al.
    Krustok, Ivo
    Nehrenheim, Emma
    Carlsson, Bengt
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Avdelningen för systemteknik. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Matematisk-datavetenskapliga sektionen, Institutionen för informationsteknologi, Reglerteknik.
    A simple model for algae-bacteria interaction in photo-bioreactors2016Inngår i: Algal Research, ISSN 2211-9264, Vol. 19, 155-161 s.Artikkel i tidsskrift (Fagfellevurdert)
    Abstract [en]

    This work presents a simple model to describe the consortia of algae-bacteria in a photo-bioreactor. The model is inspired by the Activated Sludge Model (ASM) structure, which includes different process rates and stoichiometric parameters. The model comprises two main biomass populations (algae and bacteria), two dissolved substrates (ammonium and nitrate) and two dissolved gases (oxygen and carbon dioxide) in the reactor. The model was calibrated with data from batch experiments performed in two lab-scale photo-bioreactors. A sensitivity analysis was done to identify the parameters to be considered for the model calibration. Results indicate that the maximum algae and bacteria growth rate, bacteria growth yield and half-saturation constant for carbon were the most sensitive parameters. Moreover, the comparison between the experiments and the model shows good agreement in terms of predicting the ammonium, nitrate and oxygen concentrations in the photobioreactor.

1 - 8 of 8
RefereraExporteraLink til resultatlisten
Permanent link
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annet format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annet språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf