Ändra sökning
Avgränsa sökresultatet
1 - 9 av 9
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Träffar per sida
  • 5
  • 10
  • 20
  • 50
  • 100
  • 250
Sortering
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
  • Standard (Relevans)
  • Författare A-Ö
  • Författare Ö-A
  • Titel A-Ö
  • Titel Ö-A
  • Publikationstyp A-Ö
  • Publikationstyp Ö-A
  • Äldst först
  • Nyast först
  • Skapad (Äldst först)
  • Skapad (Nyast först)
  • Senast uppdaterad (Äldst först)
  • Senast uppdaterad (Nyast först)
  • Disputationsdatum (tidigaste först)
  • Disputationsdatum (senaste först)
Markera
Maxantalet träffar du kan exportera från sökgränssnittet är 250. Vid större uttag använd dig av utsökningar.
  • 1.
    Kvarnung, Malin
    et al.
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Shahsavani, Mansoureh
    Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Biomed, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Taylan, Fulya
    Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Moslem, Mohsen
    Karolinska Inst, Biomed, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Breeuwsma, Nicole
    Karolinska Inst, Biomed, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Schuster, Jens
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Jin, Zhe
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Nilsson, Daniel
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Lieden, Agne
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Anderlid, Britt-Marie
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Nordenskjold, Magnus
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Lundberg, Elisabeth Syk
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Birnir, Bryndis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Nordgren, Ann
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Lindstrand, Anna
    Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden;Karolinska Inst, Ctr Mol Med, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Falk, Anna
    Karolinska Inst, Biomed, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Ataxia in Patients With Bi-Allelic NFASC Mutations and Absence of Full-Length NF1862019Ingår i: Frontiers in Genetics, ISSN 1664-8021, E-ISSN 1664-8021, Vol. 10, artikel-id 896Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    The etiology of hereditary ataxia syndromes is heterogeneous, and the mechanisms underlying these disorders are often unknown. Here, we utilized exome sequencing in two siblings with progressive ataxia and muscular weakness and identified a novel homozygous splice mutation (c.3020-1G > A) in neurofascin (NFASC). In RNA extracted from fibroblasts, we showed that the mutation resulted in inframe skipping of exon 26, with a deprived expression of the full-length transcript that corresponds to NFASC isoform NF186. To further investigate the disease mechanisms, we reprogrammed fibroblasts from one affected sibling to induced pluripotent stem cells, directed them to neuroepithelial stem cells and finally differentiated to neurons. In early neurogenesis, differentiating cells with selective depletion of the NF186 isoform showed significantly reduced neurite outgrowth as well as fewer emerging neurites. Furthermore, whole-cell patch-clamp recordings of patient-derived neuronal cells revealed a lower threshold for openings, indicating altered Na+ channel kinetics, suggesting a lower threshold for openings as compared to neuronal cells without the NFASC mutation. Taken together, our results suggest that loss of the full-length NFASC isoform NF186 causes perturbed neurogenesis and impaired neuronal biophysical properties resulting in a novel early-onset autosomal recessive ataxia syndrome.

  • 2.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Induced pluripotent stem cell (iPSC) modelling for the identification of mechanisms behind neurodevelopmental disorders2020Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Human induced pluripotent stem cells (iPSCs) have opened new possibilities to recapitulate disease mechanisms and to model disorders in vitro. In the studies presented here, iPSCs were established to model neural differentiation in Down syndrome (DS), caused by trisomy for chromosome 21 (T21); Dravet syndrome (DRS), caused by variants in the SCN1A gene; and an ataxia syndrome, caused by a variant in the NFASC gene. The major aim has been to uncover molecular and cellular mechanisms behind perturbed neurogenesis in the three disorders.

    In Paper I, the analysis of transcriptomes and proteomes of the DS iPSC derived neural model revealed several perturbed gene clusters with strong temporal dynamics along neural differentiation, markedly down-regulated mitochondrial genes and a dysregulation of hub proteins. These results predict complex and genome-wide changes in T21 neural cells associated with prolonged cell cycle, reduced cell growth and a perturbed energy metabolism.

    In Paper II, it was demonstrated that the transcriptional profile of iPSC based neural model system for DS was enriched for differentially methylated genes and gene families when compared to a corresponding euploid model. The differentially methylated genes were enriched for transcriptional regulation and chromatin structure, suggesting novel mechanistic links between the genomic imbalance caused by T21 and the global transcriptional dysregulation in DS.

     In Paper III, it was shown that DRS patient iPSCs differentiated into GABAergic interneurons exhibit a dysregulated epilepsy gene network as well as an altered expression of genes involved in chromatin remodelling, accompanied by abnormal electrophysiological properties and increased stress sensitivity.

    In Paper IV, it was shown that neural iPSCs, established from a patient with an ataxia syndrome and a novel homozygous variant in the NFASC gene, lack a full-length neurofascin-186 important for cell adhesion. The patient derived neural iPSCs showed delayed neuronal differentiation, reduced sprouting, shorter neurites and altered electrophysiology.

    The Papers I-IV show that patient derived neural iPSCs enable to identify molecular and cellular mechanisms associated with neuropathogenesis. Besides specific dysregulated pathways and cellular defects in models of three developmental disorders, with shortlists of novel candidate disease biomarkers, the results are consistent with prior data and clinical presentation of patients. The knowledge gained is of paramount importance for translation into clinical settings and a step towards development of novel therapies with the ultimate goal to alleviate symptoms of affected individuals.

  • 3.
    Laan, Loora
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Klar, Joakim
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Sobol, Maria
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Hoeber, Jan
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Shahsavan, Mansoureh
    Department of Neuroscience, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
    Kele, Malin
    Department of Neuroscience, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
    Fatima, Ambrin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Zakaria, Muhammad
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Annerén, Göran
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Falk, Anna
    Department of Neuroscience, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden.
    Schuster, Jens
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    DNA methylation changes in Down syndrome derived neural iPSCs uncover co-dysregulation of ZNF and HOX3 families of transcription factors2020Ingår i: Clinical Epigenetics, E-ISSN 1868-7083, Vol. 12, artikel-id 9Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Background: Down syndrome (DS) is characterized by neurodevelopmental abnormalities caused by partial or complete trisomy of human chromosome 21 (T21). Analysis of Down syndrome brain specimens has shown global epigenetic and transcriptional changes but their interplay during early neurogenesis remains largely unknown. We differentiated induced pluripotent stem cells (iPSCs) established from two DS patients with complete T21 and matched euploid donors into two distinct neural stages corresponding to early- and mid-gestational ages.

    Results: Using the Illumina Infinium 450K array, we assessed the DNA methylation pattern of known CpG regions and promoters across the genome in trisomic neural iPSC derivatives, and we identified a total of 500 stably and differentially methylated CpGs that were annotated to CpG islands of 151 genes. The genes were enriched within the DNA binding category, uncovering 37 factors of importance for transcriptional regulation and chromatin structure. In particular, we observed regional epigenetic changes of the transcription factor genes ZNF69, ZNF700 and ZNF763 as well as the HOXA3, HOXB3 and HOXD3 genes. A similar clustering of differential methylation was found in the CpG islands of the HIST1 genes suggesting effects on chromatin remodeling.

    Conclusions: The study shows that early established differential methylation in neural iPSC derivatives with T21 are associated with a set of genes relevant for DS brain development, providing a novel framework for further studies on epigenetic changes and transcriptional dysregulation during T21 neurogenesis.

  • 4.
    Lam, Matti
    et al.
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Moslem, Mohsen
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Bryois, Julien
    Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden.
    Pronk, Robin J.
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Uhlin, Elias
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Ellström, Ivar Dehnisch
    Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Stockholm, Sweden.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Olive, Jessica
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Morse, Rebecca
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Rönnholm, Harriet
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Louhivuori, Lauri
    Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Stockholm, Sweden.
    Korol, Sergiy V.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Uhlén, Per
    Karolinska Inst, Dept Med Biochem & Biophys, Stockholm, Sweden.
    Anderlid, Britt-Marie
    Karolinska Inst, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden.
    Kele, Malin
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Sullivan, Patrick F.
    Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden.
    Falk, Anna
    Karolinska Inst, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Single cell analysis of autism patient with bi-allelic NRXN1-alpha deletion reveals skewed fate choice in neural progenitors and impaired neuronal functionality2019Ingår i: Experimental Cell Research, ISSN 0014-4827, E-ISSN 1090-2422, Vol. 383, nr 1, artikel-id UNSP 111469Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    We generated human iPS derived neural stem cells and differentiated cells from healthy control individuals and an individual with autism spectrum disorder carrying bi-allelic NRXN1-alpha deletion. We investigated the expression of NRXN1-alpha during neural induction and neural differentiation and observed a pivotal role for NRXN1-alpha during early neural induction and neuronal differentiation. Single cell RNA-seq pinpointed neural stem cells carrying NRXN1-alpha deletion shifting towards radial glia-like cell identity and revealed higher proportion of differentiated astroglia. Furthermore, neuronal cells carrying NRXN1-alpha deletion were identified as immature by single cell RNA-seq analysis, displayed significant depression in calcium signaling activity and presented impaired maturation action potential profile in neurons investigated with electrophysiology. Our observations propose NRXN1-alpha plays an important role for the efficient establishment of neural stem cells, in neuronal differentiation and in maturation of functional excitatory neuronal cells.

  • 5.
    Schuster, Jens
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Fatima, Ambrin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Schwarz, Franziska
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Klar, Joakim
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Generation of human induced pluripotent stem cell (iPSC) lines from three patients with von Hippel-Lindau syndrome carrying distinct VHL gene mutations2019Ingår i: Stem Cell Research, ISSN 1873-5061, E-ISSN 1876-7753, Vol. 38, artikel-id UNSP 101474Artikel i tidskrift (Övrigt vetenskapligt)
    Abstract [en]

    Von Hippel-Lindau (VHL) syndrome is a familial cancer syndrome caused by mutations in the tumor suppressor gene VHL. We generated human iPSC lines from primary dermal fibroblasts of three VHL syndrome patients carrying distinct VHL germ line mutations (c.194C > G, c.194C > T and nt440delTCT, respectively). Characterization of the iPSC lines confirmed expression of pluripotency markers, trilineage differentiation potential and absence of exogenous vector expression. The three hiPSC lines were genetically stable and retained the VHL mutation of each donor. These iPSC lines, the first derived from VHL syndrome patients, offer a useful resource to study disease pathophysiology and for anti-cancer drug development.

  • 6.
    Schuster, Jens
    et al.
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Fatima, Ambrin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Sobol, Maria
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Noraddin, Feria Hikmet
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Klinisk och experimentell patologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Generation of three human induced pluripotent stem cell (iPSC) lines from three patients with Dravet syndrome carrying distinct SCN1A gene mutations2019Ingår i: Stem Cell Research, ISSN 1873-5061, E-ISSN 1876-7753, Vol. 39, artikel-id 101523Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Dravet syndrome (DS) is a childhood epilepsy syndrome caused by heterozygous mutations in the SCN1A gene encoding voltage-gated sodium channel Nav1.1. We generated iPSCs from fibroblasts of three DS patients carrying distinct SCN1A mutations (c.5502-5509dupGCTTGAAC, c.2965G>C and c.651C>G). The iPSC lines were genetically stable and each line retained the SCN1A gene mutation of the donor fibroblasts. Characterization of the iPSC lines confirmed expression of pluripotency markers, absence of exogenous vector expression and trilineage differentiation potential. These iPSC lines offer a useful resource to investigate the molecular mechanisms underlying Nav1.1 haploinsufficiency and for drug development to improve treatment of DS patients.

  • 7.
    Schuster, Jens
    et al.
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Klar, Joakim
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Jin, Zhe
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Huss, Mikael
    Stockholm Univ, Dept Biochem & Biophys, Sci Life Lab, Wallenberg Long Term Bioinformat Support, Stockholm, Sweden.
    Korol, Sergiy
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Noraddin, Feria Hikmet
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Klinisk och experimentell patologi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Sobol, Maria
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Birnir, Bryndis
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för neurovetenskap, Birnir: Molekylär fysiologi och neurovetenskap.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Transcriptomes of Dravet syndrome iPSC derived GABAergic cells reveal dysregulated pathways for chromatin remodeling and neurodevelopment2019Ingår i: Neurobiology of Disease, ISSN 0969-9961, E-ISSN 1095-953X, Vol. 132, artikel-id 104583Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Dravet syndrome (DS) is an early onset refractory epilepsy typically caused by de novo heterozygous variants in SCN1A encoding the a-subunit of the neuronal sodium channel Na(v)1.1. The syndrome is characterized by age related progression of seizures, cognitive decline and movement disorders. We hypothesized that the distinct neurodevelopmental features in DS are caused by the disruption of molecular pathways in Na(v)1.1 haploinsufficient cells resulting in perturbed neural differentiation and maturation. Here, we established DS-patient and control induced pluripotent stem cell derived neural progenitor cells (iPSC NPC) and GABAergic interneuronal (iPSC GABA) cells. The DS-patient iPSC GABA cells showed a shift in sodium current activation and a perturbed response to induced oxidative stress. Transcriptome analysis revealed specific dysregulations of genes for chromatin structure, mitotic progression, neural plasticity and excitability in DS-patient iPSC NPCs and DS-patient iPSC GABA cells versus controls. The transcription factors FOXM1 and E2F1, positive regulators of the disrupted pathways for histone modification and cell cycle regulation, were markedly up-regulated in DS-iPSC GABA lines. Our study highlights transcriptional changes and disrupted pathways of chromatin remodeling in Na(v)1.1 haploinsufficient GABAergic cells, providing a molecular framework that overlaps with that of neurodevelopmental disorders and other epilepsies.

  • 8.
    Schuster, Jens
    et al.
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Sobol, Maria
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Fatima, Ambrin
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Khalfallah, Ayda
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Anderlid, Britt-Marie
    Karolinska Univ Hosp, Dept Mol Med & Surg, Ctr Mol Med, Stockholm, Sweden;Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden.
    Nordgren, Ann
    Karolinska Univ Hosp, Dept Mol Med & Surg, Ctr Mol Med, Stockholm, Sweden;Karolinska Univ Hosp, Dept Clin Genet, Stockholm, Sweden.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Mowat-Wilson syndrome: Generation of two human iPS cell lines (UUIGPi004A and UUIGPi005A) from siblings with a truncating ZEB2 gene variant2019Ingår i: Stem Cell Research, ISSN 1873-5061, E-ISSN 1876-7753, Vol. 39, artikel-id 101518Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Mowat-Wilson syndrome (MWS) is a complex developmental syndrome caused by heterozygous mutations in the Zinc finger E-box-binding homeobox 2 gene (ZEB2). We generated the first human iPSC lines from primary fibroblasts of two siblings with MWS carrying a heterozygous ZEB2 stop mutation (c.1027C > T; p.Arg343*) using the Sendai virus reprogramming system. Both iPSC lines were free from reprogramming vector genes, expressed pluripotency markers and showed potential to differentiate into the three germ layers. Genetic analysis confirmed normal karyotypes and a preserved stop mutation. These iPSC lines will provide a useful resource to study altered neural lineage fate and neuropathophysiology in MWS.

  • 9.
    Sobol, Maria
    et al.
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Klar, Joakim
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Laan, Loora
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Shahsavani, Mansoureh
    Karolinska Inst Solna, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Schuster, Jens
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Annerén, Göran
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Konzer, Anne
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC, Analytisk kemi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Mi, Jia
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC, Analytisk kemi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala Univ, Dept Chem BMC Analyt Chem, Box 599, SE-75124 Uppsala, Sweden.
    Bergquist, Jonas
    Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Kemiska sektionen, Institutionen för kemi - BMC, Analytisk kemi. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Nordlund, Jessica
    Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för medicinska vetenskaper, Molekylär medicin. Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.
    Hoeber, Jan
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Huss, Mikael
    Stockholm Univ, Natl Bioinformat Infrastruct Sweden, Sci Life Lab, Dept Biochem & Biophys, Solna, Sweden.
    Falk, Anna
    Karolinska Inst Solna, Dept Neurosci, Stockholm, Sweden.
    Dahl, Niklas
    Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet, Medicinska fakulteten, Institutionen för immunologi, genetik och patologi, Medicinsk genetik och genomik.
    Transcriptome and Proteome Profiling of Neural Induced Pluripotent Stem Cells from Individuals with Down Syndrome Disclose Dynamic Dysregulations of Key Pathways and Cellular Functions2019Ingår i: Molecular Neurobiology, ISSN 0893-7648, E-ISSN 1559-1182, Vol. 56, nr 10, s. 7113-7127Artikel i tidskrift (Refereegranskat)
    Abstract [en]

    Down syndrome (DS) or trisomy 21 (T21) is a leading genetic cause of intellectual disability. To gain insights into dynamics of molecular perturbations during neurogenesis in DS, we established a model using induced pluripotent stem cells (iPSC) with transcriptome profiles comparable to that of normal fetal brain development. When applied on iPSCs with T21, transcriptome and proteome signatures at two stages of differentiation revealed strong temporal dynamics of dysregulated genes, proteins and pathways belonging to 11 major functional clusters. DNA replication, synaptic maturation and neuroactive clusters were disturbed at the early differentiation time point accompanied by a skewed transition from the neural progenitor cell stage and reduced cellular growth. With differentiation, growth factor and extracellular matrix, oxidative phosphorylation and glycolysis emerged as major perturbed clusters. Furthermore, we identified a marked dysregulation of a set of genes encoded by chromosome 21 including an early upregulation of the hub gene APP, supporting its role for disturbed neurogenesis, and the transcription factors OLIG1, OLIG2 and RUNX1, consistent with deficient myelination and neuronal differentiation. Taken together, our findings highlight novel sequential and differentiation-dependent dynamics of disturbed functions, pathways and elements in T21 neurogenesis, providing further insights into developmental abnormalities of the DS brain.

1 - 9 av 9
RefereraExporteraLänk till träfflistan
Permanent länk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf