Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Förekomst av Mycobacterium avium i vattenprover från barns närmiljö: med fokus på badleksaker
Linnaeus University, Faculty of Health and Life Sciences, Department of Chemistry and Biomedical Sciences.
2015 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

Mykobakterier är grampositiva bakterier som hör till familjen Mycobacteriaceae. Inom släktet Mycobacterium finns det mer än 50 arter av mykobakterier som ger upphov till sjukdomar hos människan, där den viktigaste arten är M. tuberculosis. Icke-tuberkulösa mykobakterier benämns även som miljömykobakterier. En del arter kan leva i miljöer med mycket låga halter av näringsämnen samt i akvatiska miljöer och återfinns i bl.a. vatten, jord, kärr och sumpmarker. Vissa miljömykobakteriearter är patogena och framkallar sjukdomar hos människan och även djur. Oftast är de opportunistiskt patogena, dvs. angriper och infekterar människan vid starkt nedsatt immunförsvar eller kronisk sjukdom.

Två mykobakteriearter vid namn Mykobakterium avium avium och Mykobakterium avium hominissuis tillhör undergruppen Mykobakterium avium komplex (MAC).

Friska barn mellan 1 och 5 år är en utsatt grupp för MAC-infektioner. När barnen infekteras med MAC, uppstår en lymfkörtelinflammation (lymfadenit) runt halsområdet. Eftersom det inte konstaterats någon MAC-smitta människor emellan, spekuleras det över andra möjliga vägar för MAC-bakterier att nå och infektera vuxna och barn med lymfadenit.  Det antas att MAC infekterar människan via naturen samt dricksvattnet. 

Syftet med studien var att utveckla en metod för att detektera förekomst av M. avium bakterier i vanligt kranvatten från Öland, Kalmar och Hultsfred, inkuberat i badankor. I syftet ingick också att experimentellt undersöka om M. avium överlever och/ eller anrikar sig i badanksmiljön. De metoder som utvärderades var odling med efterföljande detektion via MALDI-TOF samt triplex q-PCR.  

Studien utfördes på rena (nya) och smutsiga (använda) badankor innehållande kranvatten från Öland, Kalmar och Hultsfred, där vissa injicerades med kända stammar av M. avium avium och M. avium hominissuis och inkuberades i fem veckor. Från vattnet från respektive badanka extraherades DNA som analyserades med q-PCR. Dessutom gjordes utstryk från vattenproven och odlades på näringsrik agar för att senare, om möjligt, detektera med MALDI-TOF.

Resultatet av studien med q-PCR visade detektion av bakterierna M. avium avium och M. avium hominissus i samtliga miljöprover. En trolig orsak till detta kan vara att extraktionslösningarna som användes varit kontaminerade. Studien visade dock att mykobakterier överlevde i badanksmiljö.

Abstract [en]

Mycobacteria are gram-positive bacteria belonging to the Mycobacteriaceae family. There are more than 50 different species of the mycobacteria which can cause diseases in humans, the most important one being M. tuberculosis. Non-tuberculous mycobacteria are also called environmental mycobacteria. Some species can survive in areas with very low amounts of nutrients along with aquatic areas, such as water, dirt, swamps, and marshes. Some environmental mycobacteria are pathogenic and can cause diseases in humans and animals. They are mostly opportunistic pathogens, i.e. they infect humans with an already weakened immune system or humans who suffer from chronic diseases. Two species of mycobacteria named Mycobacterium avium avium and Mycobacterium avium hominissuis belong to the subgroup Mycobacterium avium complex (MAC). Healthy children between the ages of 1 and 5 are an exposed group to MAC-infections. When these children are infected with MAC, they develop an inflammation in the lymph nodes (Lymphadenitis) in the neck area. Since no direct transmission between humans has been established, it has been speculated that the MAC-bacteria take a different route to reach and infect adults and children with lymphadenitis. It has been hypothesized that MAC infect humans through nature and drinking water.

The purpose of this study was to develop a method to detect the occurrence of M. avium bacteria in tap water from Öland, Kalmar, and Hultsfred, incubated in rubber ducks. The purpose was also to investigate experimentally if M. avium can survive and/or thrive in a rubber duck environment. The methods which have been evaluated in the study were cultivation followed by detection by MALDI-TOF and also triplex q-PCR.  

The study was done on clean (new) and contaminated (used) rubber ducks with tap water from Öland, Kalmar, and Hultsfred, where some rubber ducks were injected with known strains from M. avium avium and M. avium hominissuis and incubated for five weeks. DNA was extracted from the water and biofilm samples from each rubber duck, for further analysis with q-PCR. Furthermore, a culture from the same water samples was made on nutritious agar for later detection by MALDI-TOF.

The results of this study using q-PCR showed detection of the bacteria M. avium avium and M. avium hominissuis in all the samples. A possible, and believable, reason for this could be that the extraction solutions used in this study were contaminated. However, the study show that the mycobacteria survive in rubber duck environment.

Place, publisher, year, edition, pages
2015. , p. 33
National Category
Biomedical Laboratory Science/Technology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:lnu:diva-47361OAI: oai:DiVA.org:lnu-47361DiVA, id: diva2:873165
Subject / course
Biomedical Sciences
Educational program
Biomedical Laboratory Science Programme, 180 credits
Supervisors
Examiners
Available from: 2015-12-01 Created: 2015-11-23 Last updated: 2015-12-01Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(1693 kB)147 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 1693 kBChecksum SHA-512
a8c13d654e7da0b489273c013fc00c00a033c6b78b5bbbc7debcf1cb26a9439d43bee40249ec2a97207c915932e9080454f313cce780f7c1f0ab37571f043278
Type fulltextMimetype application/pdf

Search in DiVA

By author/editor
Al-Asafi, Zainab
By organisation
Department of Chemistry and Biomedical Sciences
Biomedical Laboratory Science/Technology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 147 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 453 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf