Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Konstruktion av en mindre variant av plasmiden pQlacZ-1
Karlstad University, Faculty of Technology and Science.
2012 (Swedish)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesisAlternative title
Construction of a smaller version of the plasmid pQlacZ-1 (English)
Abstract [sv]

   Syftet med detta projekt var att konstruera en mindre variant av pQlacZ-1 för att senare kunna använda den som reportervektor i Ideonella dechloratans. pQlacZ-1 är en plasmid som är 17,1 kbp stor, som skulle kunna användas som reportervektor i  Ideonella dechloratans för att kunna undersöka olika promotorsekvenser. Detta är möjligt eftersom pQlacZ-1 är en broad host range plasmid och saknar promotorsekvensen för lacZ genen. Ett problem med pQlacZ-1 är dess storlek vilket gör den svår att transformera, och då speciellt i Ideonella dechloratans som är svår att transformera överhuvudtaget. En stor del av projektet har lagts på att ta reda på hur pQlacZ-1 ser ut i detalj, då detta inte finns väl beskrivet. Även efter denna studie saknas information om ett fragment för att få en helt klar bild över hur plasmiden är uppbyggd. Efter att ha ställt upp en hypotes om hur plasmiden ser ut så identifierades ett område som kunde klyvas bort och det var fragmentet med lacA och lacY. Detta gjordes  genom en dubbelklyvning med SalI och BstBI. Den nya mindre varianten av plasmiden har jag valt att kalla pQlacZ-1cc och den ska teoretiskt sett vara ca 13427 bp stor, vilket bör göra den lättare att jobba med. Ytterligare arbete behövs för att verifiera konstruktionen i pQlacZ-1cc.

Abstract [en]

   The aim with this project was to design a smaller version of pQlacZ-1 in order to later use it as a reporter vector in Ideonella dechloratans.  pQlacZ-1 is a plasmid that is 17,1 kbp big, which might be used as a reporter vector in Ideonella dechloratans to investigate different promoter sequences. This is possible because pQlacZ-1 is a broad host range plasmid and lacks the promoter sequence of the lacZ gene. A problem with pQlacZ-1 is its size which makes it difficult to transform, and especially in Ideonella dechloratans which is difficult to transform at all. A large part of the project has been about finding out how pQlacZ-1 looks like in detail, as this is not well described. Even after this study information about one fragment is missing to get a completely clear picture of how the plasmid is constructed. After formulation of a hypothesis about how the plasmid is constructed, a section that could be removed was identified. The part of pQlacZ-1 that was removed was the lacA and lacY. This was done by a double digestion with SalI and BstBI. The new smaller version of the plasmid, is called pQlacZ-1cc. Theoretically it should be about 13427 bp, which should make it easier to work with. Additional work is required to verify the design of pQlacZ-1cc.

Place, publisher, year, edition, pages
2012. , 33 p.
Keyword [sv]
pQlacZ-1, mindre variant
National Category
Chemical Sciences
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kau:diva-16390Local ID: KEM-32OAI: oai:DiVA.org:kau-16390DiVA: diva2:588706
Subject / course
Chemistry
Uppsok
Physics, Chemistry, Mathematics
Supervisors
Examiners
Available from: 2013-01-23 Created: 2013-01-15 Last updated: 2016-10-10Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(986 kB)392 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 986 kBChecksum SHA-512
27bacfdb5e31897f2a6910acf7e3a21a143a3b281ee1118e49ef6991d18df9f76113662c0445489a74e2ca943813de654812572179533144224af7a73b749f92
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
Faculty of Technology and Science
Chemical Sciences

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 392 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 98 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf