Ecocom AB har på uppdrag av Länsstyrelsen Jönköping genomfört inventering av fladdermöss i Ängsö. Uppdraget ingår i den nationella biogeografiska uppföljningen av fladdermöss som syftar till att följa upp hur fladdermusfaunan utvecklas i några av Sveriges mest artrika områden. Ett inventeringsbesök genomfördes år 2021 och ett inventeringsbesök 2022. Vid varje besök utfördes en manuell inventering och en autoboxinventering med sex autoboxar som spelade in fladdermössen i två nätter i sträck. Under inventeringen 2021 påträffades totalt åtta arter och år 2022 11 arter, varav fem arter är rödlistade: brunlångöra, nordfladdermus, fransfladdermus, sydfladdermus och sydpipistrell. Den vanligast förekommande arten är dvärgpipistrell. Dammfladdermus kunde inte återfinnas. Ängsö är känd för att vara en artrik fladdermuslokal med hög täthet av kolonier (Ahlén & De Jong, muntligt). Ängsö framstår fortsatt som ett artrikt område för fladdermusfaunan norr om Mälaren.