Calluna AB har, på uppdrag av Länsstyrelsen Jönköping, genomfört inventering av fladdermöss i Ängsö. Uppdraget ingår i den nationella biogeografiska uppföljningen av fladdermöss som syftar till att följa upp hur fladdermusfaunan utvecklas i några av Sveriges mest artrika områden. Callunas undersökning har utförts med två inventeringsbesök. Vid varje besök utfördes en manuell inventering och en autoboxinventering med sex autoboxar som spelade in fladdermössen i två nätter i sträck. Under inventeringen 2023 påträffades 10 arter, varav fyra arter är rödlistade: brunlångöra, nordfladdermus, sydfladdermus och sydpipistrell. Totalt har 13 arter påträffats i Ängsö, dammfladdermus och fransfladdermus återfanns inte och mustasch- och tajgafladdermus skiljdes inte år 2023. En trolig koloni av tajgafladdermus finns i Ängsö kyrka. Den noterades även år 2021 och år 2022.