Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Calculating Center of Mass Using List Mode Data from PET Biograph128 mCT-1104
KTH, School of Engineering Sciences in Chemistry, Biotechnology and Health (CBH), Biomedical Engineering and Health Systems.
KTH, School of Engineering Sciences in Chemistry, Biotechnology and Health (CBH), Biomedical Engineering and Health Systems.
2019 (English)Independent thesis Basic level (degree of Bachelor), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesisAlternative title
Beräkning av masscentrum genom användning av list mode data från PET Biograph128 mCT-1104 (Swedish)
Abstract [en]

A common problem within positron emission tomography examinations of the brain is the motion of the patient. If the patients ́ head moves during an examination all the data acquired after the movement will not be suited for clinical use. This means that a lot of data recovered from PET is not used at all.

Motion tracking during PET acquisitions of the brain is not a well explored issue within medical imaging in relation to the magnitude of the problem. Due to the radiation risks of the examination and the logistics at the hospital, a second acquisition is not preferred. Therefore a method to avoid a second acquisition would be welcome.

PET data saved in list mode makes it possible to analyze the data during an examination. By calculating the center of mass of the object examined in list mode only using the raw data from PET and use it as a tracking point, it would be possible to track a motion during an acquisition. The center of mass could therefore possibly be used as a reference to connect two different time intervals on each side of the moment were the motion occurred.

The raw PET data used for this project was acquired in the Nuclear Medicine Department in Karolinska University Hospital in Huddinge and covered four turns of one minute acquisitions in different positions and with two different objects that were saved in list mode. The acquisitions were analyzed with the Siemens software e7-tools and sliced into time intervals.

To calculate the center of mass within these time intervals, two methods were developed. One method only used the Siemens software e7-tools and histogrammed the time of flight bin position. The other method used each event position in its sinogram to calculate a center of mass sinusoidal equation. This equation lead to coordinates describing the center of mass in a specific slice.

Abstract [sv]

Ett vanligt problem inom positronemissiontomografiundersökningar av hjärnan är rörelser från patienten. Om patienten rör sitt huvud under undersökningen kommer all förvärvad data inte vara kliniskt lämpad. Detta innebär att en stor del av datan från en PET-undersökning inte används över huvud taget.

Rörelsespårning under PET undersökningar av hjärnan är ett relativt outforskat ämne inom medicinsk bildgivning i relation till amplituden av problemet. På grund av strålningsrisken av un- dersökningen och logistiken på sjukhusen, är en andra bildtagning inte att föredra. Därför skulle en metod för att undvika en andra bildtagning vara uppskattad.

PET-rådata sparad i list mode möjliggör analys av data inom tidsspektrat av en undersökning. Genom att beräkna det undersökta objektets barocentrum genom att enbart använda rådata sparad i list mode och använda detta som en referenspunkt, så finns en möjlighet att följa en rörelse under en undersökning. Objektets barocentrum skulle kunna fungera som en referenspunkt för att binda ihop två olika tidsegment på varsin sida om tillfället då en rörelse har skett.

Rådatan som användes i detta projekt var förvärvad vid nukleärmedicinska avdelningen på Karolinska Universetetssjukhuset i Huddinge och täckte fyra stycken undersökningar på en minut vardera i olika positioner och två olika objekt som sparades i list mode. Datainsamlingarna över- sattes med Siemens-mjukvaran e7-tools och delades sedan upp i tidsegment.

För att räkna ut ett barocentrum i dessa tidssegment så utvecklades två metoder. En metod använde sig enbart av Siemens-mjukvaran e7-tools och använde dess funktion ”histogramming” för att dela upp alla events time of flight position. Den andra metoden använde varje events position i dess sinogram för att beräkna en barocentrisk sinusformad funktion. Denna funktion ledde till koordinater som beskrev masscentrum i en specifik skiva.

Place, publisher, year, edition, pages
2019.
Series
TRITA-CBH-GRU ; 065
Keywords [en]
PET, List Mode, Image Reconstruction, e7-tools, Siemens, Center of Mass
Keywords [sv]
PET, List Mode, Bildrekonstruktion, e7-tools, Siemens, Masscentrum
National Category
Radiology, Nuclear Medicine and Medical Imaging
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kth:diva-256084OAI: oai:DiVA.org:kth-256084DiVA, id: diva2:1343968
Subject / course
Medical Engineering
Educational program
Master of Science in Engineering - Medical Engineering
Supervisors
Examiners
Available from: 2019-09-03 Created: 2019-08-19 Last updated: 2019-09-03Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(1294 kB)16 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 1294 kBChecksum SHA-512
6a311752f5dee1d34fc3fa85adf504b4ee5bc2757052fa69bfb61d5c6532d64463eaecafff9c3f992ee9c98333a79b5556adc410ed20f273717e45884726a575
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
Biomedical Engineering and Health Systems
Radiology, Nuclear Medicine and Medical Imaging

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 16 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 49 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf