Change search
ReferencesLink to record
Permanent link

Direct link
Undersökning av jonvätskematrisers detektion på olika typer av MALDI plattor
KTH, School of Chemical Science and Engineering (CHE).
2016 (Swedish)Independent thesis Basic level (professional degree), 10 credits / 15 HE creditsStudent thesisAlternative title
Detection of ionic liquid matrices on variousMALDI plates (English)
Abstract [sv]

Examensarbetet gjordes för att undersöka om det istället för 2,5-dihydroxidbensoesyra fanns en jonvätskematris som hade en lika bra eller bättre detektionsgrad. Examensarbetet undersökte också om det var någon detektions skillnad på stål- och koncentrationsplatta när analysmetoden matris-assisterande laser desorption-jonisation-masspektrometri (MALDI-MS) analysmetod används. Jonvätskematris är en matris som binder till en svag bas och är till för att skydda peptiderna från addukter. Baserna som undersöktes var etylamin, dietylamin, diisopropylamin och N,N-etyl-diisopropylamin. Examensarbetet jämförde matrisen med jonvätskematriserna som alla var upplösta i etanol, vatten eller en vätskeblandning (TA 30) (0,1 % trifluorättiksyra i vatten och acetonitril i 7:3 volym). Det utfördes tester genom att matrisen och jonvätskematriserna blandades med en peptidblandning innehållande åtta stycken peptider. Blandningen deponerades på en stål- och en koncentrationsplatta. Efter att blandningen hade torkat på plattorna och bilde till kristaller eller en vätskefilm placerades plattorna i MALDI-apparaturen. Testerna utvisade att N,N-etyl diisopropylamin blandningen i etanol och vätskeblandningen var bättre än 2,5-dihydroxybenzene på att detektera antalet peptider på koncentrationsplattan. Det visades att etylamin och dietylamin hade samma detektiongrad som 2,5-dihydroxidbensoesyra i etanol och vatten vid detektion av antal peptider på koncentrationsplattan. En detektionsskillnad fanns mellan stål- och koncentrationsplatta. Stålplattan var bättre på att detektera tyr-bradykinin. Vid vidare studier på området skulle testerna utföras på stålplatta för att detektera tyr-bradykinin och resterande peptider på koncentrationsplatta. Vid vidare studier skulle TA 30 och etanol som lösningsmedel användas och matriserna ska upplösas i mol-koncentration istället för vikt-koncentration, för att få en mer jämförbar detektion.

Abstract [en]

This degree project was made to examine if there was a better ionic liquid matrix instead of the matrix 2,5-dihydroxybenzene. The aim of the project was also to investigate if there were any detection differences between anchorchip and groundsteel plate when testing matrix assisted laser desorption ionization masspectrometry (MALDI-MS). An ionic liquid matrix is a matrix that binds to a base used to protect the peptides from adducts. In the degree project 2,5-dihydroxybenzene was compared with the ionic liquid matrices which is 2,5-dihydroxybenzene combined with a base. The bases were ethylamine, diethylamine, diisopropylamine and N,N- ethyldiisopropylamine. All matrices were dissolved in ethanol, water or a liquid mix (0,1 % Trifluoroacetic acid in water and acetonitril in 7:3 volume). The tests were performed by mixing the matrix and the ionic liquid matrices with a peptide mix which contained 8 types of peptides. The matrix/ionic liquid matrices and peptide mix was deposited on a ground steel and anchorchip MALDI plate. After the mixture had evaporated and transformed to crystals/film, the plates were put in MADLI equipment. The results showed that N,N- ethyldiisopropylamine in ethanol and liquid mix had better detection than 2,5-dihydroxybenzene. Ethylamine and diethylamine had the same detection as 2,5-dihydroxybenzene in ethanol on anchorchip plate. There were detection differences between the anchorchip and ground steel plate. In favor of ground steel plate when detecting tyr-bradykinin, but for detecting the rest of the peptides anchorchip is favorable. If further studies would be performed in this area it would be done in the liquid mix and ethanol as solvent. For more comparable detection results the matrices concentration should be in mol/L instead of g/L.

Place, publisher, year, edition, pages
2016.
Keyword [sv]
MALDI, Matris, Peptid, ILM, DHB
National Category
Chemical Engineering
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kth:diva-195847OAI: oai:DiVA.org:kth-195847DiVA: diva2:1045604
Educational program
Bachelor of Science in Engineering - Chemical Engineering
Available from: 2016-11-10 Created: 2016-11-10 Last updated: 2016-11-10Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(1658 kB)11 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 1658 kBChecksum SHA-512
ea519e08f64bc9d95bf00ce24b71821cd8e12f236747bb992e7e5c247d98fbb6e814b2ef1dbd1dabf753a67bf817e7a54203610f9e2ce1e3fb2224f0b3807f54
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
School of Chemical Science and Engineering (CHE)
Chemical Engineering

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 11 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

Total: 14 hits
ReferencesLink to record
Permanent link

Direct link