Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Contribution of antibody-based protein profiling to the human chromosome-centric proteome project (C-HPP)
KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.ORCID-id: 0000-0003-0198-7137
KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.ORCID-id: 0000-0003-3014-5502
KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Proteomik och nanobioteknologi. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab.ORCID-id: 0000-0002-2998-3077
Visa övriga samt affilieringar
2013 (Engelska)Ingår i: Journal of Proteome Research, ISSN 1535-3893, E-ISSN 1535-3907, Vol. 12, nr 6, s. 2439-2448Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

A gene-centric Human Proteome Project has been proposed to characterize the human protein-coding genes in a chromosome-centered manner to understand human biology and disease. Here, we report on the protein evidence for all genes predicted from the genome sequence based on manual annotation from literature (UniProt), antibody-based profiling in cells, tissues and organs and analysis of the transcript profiles using next generation sequencing in human cell lines of different origins. We estimate that there is good evidence for protein existence for 69% (n = 13985) of the human protein-coding genes, while 23% have only evidence on the RNA level and 7% still lack experimental evidence. Analysis of the expression patterns shows few tissue-specific proteins and approximately half of the genes expressed in all the analyzed cells. The status for each gene with regards to protein evidence is visualized in a chromosome-centric manner as part of a new version of the Human Protein Atlas (www.proteinatlas.org).

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2013. Vol. 12, nr 6, s. 2439-2448
Nyckelord [en]
Antibody-based protein profiling, C-HPP
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-134163DOI: 10.1021/pr300924jISI: 000320298600010PubMedID: 23276153Scopus ID: 2-s2.0-84879327718OAI: oai:DiVA.org:kth-134163DiVA, id: diva2:665567
Forskningsfinansiär
Knut och Alice Wallenbergs StiftelseEU, FP7, Sjunde ramprogrammetScience for Life Laboratory - a national resource center for high-throughput molecular bioscience
Anmärkning

QC 20131120

Tillgänglig från: 2013-11-20 Skapad: 2013-11-18 Senast uppdaterad: 2020-01-10Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Fagerberg, LinnOksvold, PerSkogs, MarieLundberg, EmmaSivertsson, ÅsaOdeberg, JacobKlevebring, DanielAl-Khalili Szigyarto, C.Björling, LisaTegel, HannaNilsson, PeterSchwenk, Jochen M.Zwahlen, MartinHober, SophiaForsberg, MattiasVon Feilitzen, KalleUhlén, Mathias
Av organisationen
Science for Life Laboratory, SciLifeLabProteomik och nanobioteknologi
I samma tidskrift
Journal of Proteome Research
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 196 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf