Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Cofactor mobility determines reaction outcome in the IMPDH and GMPR (beta-alpha)(8) barrel enzymes
Stockholms universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för biokemi och biofysik.
Stockholms universitet, Naturvetenskapliga fakulteten, Institutionen för organisk kemi.
Visa övriga samt affilieringar
2011 (Engelska)Ingår i: Nature Chemical Biology, ISSN 1552-4450, E-ISSN 1552-4469, Vol. 7, nr 12, s. 950-958Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Inosine monophosphate dehydrogenase (IMPDH) and guanosine monophosphate reductase (GMPR) belong to the same structural family, share a common set of catalytic residues and bind the same ligands. The structural and mechanistic features that determine reaction outcome in the IMPDH and GMPR family have not been identified. Here we show that the GMPR reaction uses the same intermediate E-XMP(star) as IMPDH, but in this reaction the intermediate reacts with ammonia instead of water. A single crystal structure of human GMPR type 2 with IMP and NADPH fortuitously captures three different states, each of which mimics a distinct step in the catalytic cycle of GMPR. The cofactor is found in two conformations: an 'in' conformation poised for hydride transfer and an 'out' conformation in which the cofactor is 6 angstrom from IMP. Mutagenesis along with substrate and cofactor analog experiments demonstrate that the out conformation is required for the deamination of GMP. Remarkably, the cofactor is part of the catalytic machinery that activates ammonia.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2011. Vol. 7, nr 12, s. 950-958
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi Strukturbiologi
Forskningsämne
biokemi; strukturbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:su:diva-70677DOI: 10.1038/NCHEMBIO.693ISI: 000297166200019OAI: oai:DiVA.org:su-70677DiVA, id: diva2:482270
Forskningsfinansiär
Vetenskapsrådet
Anmärkning

authorCount :12

Tillgänglig från: 2012-01-23 Skapad: 2012-01-23 Senast uppdaterad: 2017-12-08Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Stenmark, PålHimo, Fahmi
Av organisationen
Institutionen för biokemi och biofysikInstitutionen för organisk kemi
I samma tidskrift
Nature Chemical Biology
Biokemi och molekylärbiologiStrukturbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 43 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf