Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Molecular dynamics simulations of water and biomolecules wit a Monte Carlo constant pressure algorithm
Uppsala University.
Uppsala University.
Uppsala University.
Uppsala University.ORCID-id: 0000-0002-9300-614X
Visa övriga samt affilieringar
2004 (Engelska)Ingår i: Chemical Physics Letters, ISSN 0009-2614, E-ISSN 1873-4448, Vol. 384, nr 4-6, s. 288-294Artikel i tidskrift, Letter (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

A mixed molecular dynamics/Monte Carlo (MD/MC) algorithm for constant pressure simulations of arbitrary molecular systems is examined. Calculations are reported at ambient and high pressures both for liquid water systems and for a chemical reaction step in a solvated enzyme utilizing empirical valence bond potentials. The present method reproduces earlier reported results well and is computationally efficient since it does not require the virial to be evaluated at each MD step. It is also found that the effects of introducing MC volume steps on the dynamics of the system are negligible provided that the volume step sizes and updating frequencies are appropriately chosen.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Elsevier, 2004. Vol. 384, nr 4-6, s. 288-294
Nationell ämneskategori
Teoretisk kemi
Forskningsämne
Kemi, Fysikalisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:lnu:diva-51107DOI: 10.1016/j.cplett.2003.12.039OAI: oai:DiVA.org:lnu-51107DiVA, id: diva2:913267
Tillgänglig från: 2016-03-21 Skapad: 2016-03-21 Senast uppdaterad: 2018-02-26Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltext

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Bjelic, Sinisa
I samma tidskrift
Chemical Physics Letters
Teoretisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 106 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf