Digitala Vetenskapliga Arkivet

Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Implementation, Modification and Evaluation of Deep Learning Algorithm for Olfactory Bulb Segmentation
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Matematik (Inst.), Matematik (Avd.).
2024 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (masterexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)Alternativ titel
Implementering, modifiering och utvärdering av djupinlärningsalgoritm för segmentering av luktbulben (Svenska)
Abstract [en]

This thesis explores the generalizability of an automated deep learning algorithm with a U-Net architecture specifically tailored for human olfactory bulb (OB) segmentation. The study focuses on enhancing the performance of the segmentation tool through the implementation of targeted modifications, which are threshold adjustment and designing postprocessing constraints with the aim to successfully annotate the entire Human Connectome Project Young Adult (HCP-YA) dataset (n=1101, age 22-35 years). Extensive validation was conducted using multiple datasets to assess the algorithm's performance and its ability to generalize across different datasets with different scanning parameters. The results show a remarkably low percentage (5.8%) of missegmentations within the HCP-YA dataset and improvements in segmentation performance by reduction of over-segmentation. These enhancements do not only streamline the segmentation process but also increase the potential for using OB volume as a biomarker for neurodegenerative diseases. This thesis contributes to the field of medical image analysis by improving the performance and efficiency of OB segmentation tools, with strong implications for both research and clinical applications in diagnosing neurodegenerative disease.

Abstract [sv]

Detta examensarbete utreder generaliserbarheten hos en automatiserad djupinlärningsalgoritm med en U-Net-arkitektur, speciellt anpassad för segmentering av den mänskliga luktbulben. Studien fokuserar på att förbättra segmenteringsnoggrannheten genom implementering av riktade modifieringar, såsom tröskeljustering och utformning av efterbehandlingsrestriktioner i syfte att framgångsrikt annotera hela Human Connectome Project Young Adult (HCP-YA) datasetet (n=1101, ålder 22-35 år). Omfattande validering genomfördes med flera dataset för att bedöma algoritmens prestanda och dess förmåga att generalisera över olika dataset med olika skanings parametrar. Resultaten visar en anmärkningsvärt låg andel (5,8%) av felaktiga segmenteringar inom HCP-YA-datasetet samt förbättringar i segmenteringsnoggrannhet genom minskning av översegmentering. Dessa förbättringar strömlinjeformar inte bara segmenteringsprocessen utan ökar också potentialen att använda volymen av luktbulben som biomarkör för neurodegenerativa sjukdomar. Detta arbete bidrar till området medicinsk bildanalys genom att förbättra noggrannheten och effektiviteten hos verktyg för segmentering av luktbulben, med starka implikationer för både forskningsmässiga och kliniska tillämpningar vid diagnostisering av neurodegenerativa sjukdomar.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2024. , s. 49
Serie
TRITA-SCI-GRU ; 2024:282
Nyckelord [en]
Deep Learning, U-Net, Image Segmentation, Olfactory Bulb, Neuroimaging
Nyckelord [sv]
Djupinlärning, U-Net, bildsegmentering, luktbulb, neuroavbildning
Nationell ämneskategori
Annan matematik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-361491OAI: oai:DiVA.org:kth-361491DiVA, id: diva2:1946052
Externt samarbete
Karolinska Institutet
Ämne / kurs
Matematisk statistik
Utbildningsprogram
Teknologie masterexamen - Tillämpad matematik och beräkningsmatematik
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2025-03-20 Skapad: 2025-03-20 Senast uppdaterad: 2025-03-20Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(4067 kB)43 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4067 kBChecksumma SHA-512
933598ee06cc8127bbc2cbdefba2b734ec6eb4dd8708ecd80bc28b2041a6997b24fca7d5e9cb9468d2b14f1f75825be4d2f2964b4401e34dd68e629910864c96
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
Matematik (Avd.)
Annan matematik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 43 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 395 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf