Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Genomic data provide new insights on the demographic history and the extent of recent material transfers in Norway spruce
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Växtekologi och evolution.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Växtekologi och evolution.
Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för ekologi och genetik, Växtekologi och evolution.
Forestry Res Inst Sweden Skogforsk, Uppsala, Sweden.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Evolutionary Applications, ISSN 1752-4571, E-ISSN 1752-4571, Vol. 12, nr 8, s. 1539-1551Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Primeval forests are today exceedingly rare in Europe, and transfer of forest reproductive material for afforestation and improvement has been very common, especially over the last two centuries. This can be a serious impediment when inferring past population movements in response to past climate changes such as the last glacial maximum (LGM), some 18,000 years ago. In the present study, we genotyped 1,672 individuals from three Picea species (P. abies, P. obovata, and P. omorika) at 400K SNPs using exome capture to infer the past demographic history of Norway spruce (P. abies) and estimate the amount of recent introduction used to establish the Norway spruce breeding program in southern Sweden. Most of these trees belong to P. abies and originate from the base populations of the Swedish breeding program. Others originate from populations across the natural ranges of the three species. Of the 1,499 individuals stemming from the breeding program, a large proportion corresponds to recent introductions from mainland Europe. The split of P. omorika occurred 23 million years ago (mya), while the divergence between P. obovata and P. abies began 17.6 mya. Demographic inferences retrieved the same main clusters within P. abies than previous studies, that is, a vast northern domain ranging from Norway to central Russia, where the species is progressively replaced by Siberian spruce (P. obovata) and two smaller domains, an Alpine domain and a Carpathian one, but also revealed further subdivision and gene flow among clusters. The three main domains divergence was ancient (15 mya), and all three went through a bottleneck corresponding to the LGM. Approximately 17% of P. abies Nordic domain migrated from P. obovata ~103K years ago, when both species had much larger effective population sizes. Our analysis of genomewide polymorphism data thus revealed the complex demographic history of Picea genus in Western Europe and highlighted the importance of material transfer in Swedish breeding program.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
WILEY , 2019. Vol. 12, nr 8, s. 1539-1551
Nyckelord [en]
demographic inferences, forest management, Picea abies, population transfer
Nationell ämneskategori
Botanik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-395853DOI: 10.1111/eva.12801ISI: 000484471100004PubMedID: 31462913OAI: oai:DiVA.org:uu-395853DiVA, id: diva2:1365471
Tillgänglig från: 2019-10-25 Skapad: 2019-10-25 Senast uppdaterad: 2019-10-25Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(2901 kB)24 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 2901 kBChecksumma SHA-512
8d6a8426c40c1ded624644bf385a1683ff2e10eeb663c858b6e2e8f58346bc3c525de4ad01eaf7457a995455963c6c243c72a02057b6f782d304c162c007e4aa
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Chen, JunLi, LiliMilesi, PascalLascoux, Martin
Av organisationen
Växtekologi och evolution
I samma tidskrift
Evolutionary Applications
Botanik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 24 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 55 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf