Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Direct observation of coordinated DNA movements on the nucleosome during chromatin remodelling
Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. Uppsala universitet, Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet, Biologiska sektionen, Institutionen för cell- och molekylärbiologi, Molekylär systembiologi.
Johns Hopkins Univ, TC Jenkins Dept Biophys, Baltimore, MD 21218 USA.
Harvard Univ, Howard Hughes Med Inst, Cambridge, MA 02138 USA;Harvard Univ, Dept Chem & Chem Biol, Cambridge, MA 02138 USA;Harvard Univ, Dept Phys, Cambridge, MA 02138 USA.
Johns Hopkins Univ, TC Jenkins Dept Biophys, Baltimore, MD 21218 USA.
Visa övriga samt affilieringar
2019 (Engelska)Ingår i: Nature Communications, ISSN 2041-1723, E-ISSN 2041-1723, Vol. 10, artikel-id 1720Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

ATP-dependent chromatin remodelling enzymes (remodellers) regulate DNA accessibility in eukaryotic genomes. Many remodellers reposition (slide) nucleosomes, however, how DNA is propagated around the histone octamer during this process is unclear. Here we examine the real-time coordination of remodeller-induced DNA movements on both sides of the nucleosome using three-colour single-molecule FRET. During sliding by Chd1 and SNF2h remodellers, DNA is shifted discontinuously, with movement of entry-side DNA preceding that of exit-side DNA. The temporal delay between these movements implies a single ratelimiting step dependent on ATP binding and transient absorption or buffering of at least one base pair. High-resolution cross-linking experiments show that sliding can be achieved by buffering as few as 3 bp between entry and exit sides of the nucleosome. We propose that DNA buffering ensures nucleosome stability during ATP-dependent remodelling, and provides a means for communication between remodellers acting on opposite sides of the nucleosome.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
NATURE PUBLISHING GROUP , 2019. Vol. 10, artikel-id 1720
Nationell ämneskategori
Biokemi och molekylärbiologi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:uu:diva-382551DOI: 10.1038/s41467-019-09657-1ISI: 000464338100031PubMedID: 30979890OAI: oai:DiVA.org:uu-382551DiVA, id: diva2:1314851
Forskningsfinansiär
EU, Europeiska forskningsrådetVetenskapsrådet, VR 2015-04568Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse, KAW/WAF 2014.0183
Anmärkning

These authors contributed equally: Anton Sabantsev, Robert F. Levendosky.

Tillgänglig från: 2019-05-10 Skapad: 2019-05-10 Senast uppdaterad: 2019-05-10Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(1542 kB)57 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 1542 kBChecksumma SHA-512
6957bdfc8cfa14dc1625f5c6fb58af79d0c595f5835c2641df7e1137b244af2079a7ae999aa0a5ec3ed78f212ba0c3af55a7a50988d9344cf008e0f5fe9c9b47
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMed

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Sabantsev, AntonDeindl, Sebastian
Av organisationen
Science for Life Laboratory, SciLifeLabMolekylär systembiologi
I samma tidskrift
Nature Communications
Biokemi och molekylärbiologi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 57 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 99 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf