Digitala Vetenskapliga Arkivet

Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
OSICS Blot Washer: Automation of the Western Blot Washing Process
KTH, Skolan för industriell teknik och management (ITM), Maskinkonstruktion (Inst.).
KTH, Skolan för industriell teknik och management (ITM), Maskinkonstruktion (Inst.).
2017 (Engelska)Självständigt arbete på grundnivå (kandidatexamen), 10 poäng / 15 hpStudentuppsats (Examensarbete)
Abstract [en]

In today’s life science laboratories it is common to analyzeproteins using a method called the Western Blot process.With the process an image can be obtained and analyzedto determine the presence of specific proteins. As of todaythe process is commonly done by hand. This means thatevery 5-15 minutes a scientist manually changes a liquid.The entire wash process lasts for about 3-5 hours.BioArctic AB presented a mission to attempt to automatethis specific sequence of washing. This meant buildinga machine that could do the following:• Dispense precise amounts of three different liquids.• Provide a constant wiggling motion.• Drain waste liquid.• The entire process has to be in complete darkness.It was also preferred for the machine to be able to wash fourmembranes at once. A research question was expressed asfollows:How much does the band signal intensity of the stainedband differ between an automated and a manual WesternBlot washing cycle?To answer the research question, a demonstrator was built.With a base structure of aluminum and 3d-printed PLAplastics, electronical and mechanical components such asmicrocontrollers, flow sensors, solenoid valves, dc-motorsand stepper motors could be mounted to automate the process.The demonstrator was later run with a real samplewhose result was compared to an equal sample washed manually.The two results were very similar with the automatedwash having a slightly better result. However, since onlyone test was run, the consistency of the result requires furthertesting.

Abstract [sv]

I dagens bioteknik-, medicinteknik- och läkemedelsforskning

är det vanligt att analysera proteiner med en metod

som kallas Western Blot processen. Genom denna metod

kan en bild tas fram och analyseras för att evaluera om ett

specifikt protein finns i provet. I dagens läge görs processen

oftast för hand. Detta innebär att en forskare manuellt

måste byta en vätska varje 5-15 minuter. Detta pågår i cirka

3-5 timmar. BioArctic AB presenterade ett uppdrag att

försöka automatisera denna specifika tvättsekvens. Detta

betydde att en maskin skulle byggas som kunde utföra följande:

 

• Dispensera en precis mängd av tre olika vätskor.

• Tillföra en konstant gungande rörelse.

• Dränera avfallsvätskor.

• Hela processen måste vara mörklagd.

 

Det fanns även ett önskemål om att maskinen skulle kunna

tvätta fyra membran samtidigt. En forskningsfråga formulerades

enligt:

 

Hur mycket skiljer sig intensitetssignalen på det färgade

bandet mellan en automatiserad och en manuellt genomförd

Western Blot tvättcykel?

 

För att svara på forskningsfrågan byggdes en prototyp. Med

en struktur av aluminium och 3d-printad PLA-plast kunde

elektroniska och mekaniska komponenter såsom mikrokontrollers,

flödesgivare, magnetventiler, dc-motorer och stegmotorer

fästas för att automatisera processen. Prototypen

testades sedan med riktiga prover. Resultatet av den automatiska

tvätten jämfördes med resultatet av en manuell

tvätt av samma prov. De två resultaten var lika men det automatiskt

tvättade hade ett något bättre resultat. Eftersom

endast ett test genomfördes behöves flera genomföras för att

kunna säkerställa reproducerbara resultat.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2017. , s. 65
Nationell ämneskategori
Maskinteknik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-226663OAI: oai:DiVA.org:kth-226663DiVA, id: diva2:1200477
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2018-04-24 Skapad: 2018-04-24 Senast uppdaterad: 2022-06-26Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(33766 kB)609 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 33766 kBChecksumma SHA-512
2c9dfd4c19e93de7edb2cc657dc2a3911cf4af4c0a151105b17641fa9f9d6cad29591b52d7f544e50f5d1d92f6a041d361d0ef06f3e3745e0f6f24452ef1e5b6
Typ fulltextMimetyp application/pdf
Video(141482 kB)104 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT02.mp4Filstorlek 141482 kBChecksumma SHA-512
3b88de868663b33ad9c5eb4abcbbb395d866e2597be3a453ba9d790a7313baca50cb7f231fcecbb5cb4df14892291ff8a234df68bdf7c2596210abf414d509cb
Typ fulltextMimetyp video/mp4

Av organisationen
Maskinkonstruktion (Inst.)
Maskinteknik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 713 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 261 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf